长期过量使用酒精会损害身体的许多器官，尤其是肝脏（酒精性肝病）。由于人们不适当饮食，他们也会出现严重的维生素及其它营养物质的缺乏。

酒精性肝病包括肝脏炎症（肝炎）、脂肪肝和肝脏瘢痕（肝硬化）。被酒精损坏的肝脏不太可能清除体内有毒废物，而这些废物可能导致脑功能障碍（肝性脑病）。得肝性脑病的人表现为木讷、困倦、昏睡、神智错乱，甚至昏迷。肝性脑病是威胁生命的并急需处理的疾病。

通常，肝功能衰竭患者也会出现肝性扑翼（扑翼样震颤）。手臂伸展时，双手突然落下，然后恢复到原先的位置。扑翼样震颤类似于震颤但并不是震颤。

肝硬化会导致肝脏周围血管压力增加（门静脉高压）。这些血管中积聚的压力会导致胃和食管血管肿胀（静脉曲张）。这些肿胀的血管会破裂并严重出血，导致人们呕血。这种出血比较特殊，这是因为此时肝脏不能产生足够的凝血物质促进凝血块的形成。

过量饮酒可引起胰腺炎症（胰腺炎）。患者会出现严重腹痛及呕吐。

过量饮酒也会导致神经和脑部部分受损。当手臂和腿部的神经（外周神经）受到影响时，患者可能出现感觉丧失或手脚有针刺感。患者可出现慢性震颤。脑部掌管协调性运动的部分（小脑）受到损害时，四肢将不能很好的控制运动，并会影响平衡。长期大量饮酒会导致不可逆转的脑损伤和精神病。它还会损害脑神经的内部结构（髓鞘），导致一种叫做原发性胼胝体变性的罕见疾病。该病患者会变得有躁动、神智错乱、失智。有些病人或进展为震颤或昏迷，随后死亡。

长期大量摄入酒精可能会导致硫胺素（一类维生素B）重度缺乏。这种缺乏会导致韦尼克脑病（一种以神智错乱、走路时无法协调或无法协调眼球运动为特征的疾病），如果不及时治疗，可能会导致科尔萨科夫综合征、昏迷甚至死亡。

饮酒可能会使现有的抑郁症恶化，而且与无酒精使用障碍的人相比，酒精使用障碍者更容易变得抑郁。由于与酒精相关疾病，特别是狂饮，通常会在非饮酒时期引起强烈自责感，因此，即使不饮酒，酒精使用疾患者也容易自杀。

孕妇饮酒可能会导致胎儿发育期的重度问题，包括低出生体重、身长短、小头、心脏损伤、肌肉损伤以及智力低下或智力残障。这些效应称为胎儿酒精综合征。因此，建议孕妇避免饮酒。