亚临床甲状腺功能减退症通常无症状，然而约30%的患者表现出甲状腺功能减退症症状。本病可引起不孕不育、心包积液、神经肌肉系统功能障碍、精神症状、高脂血症等并发症。

亚临床甲减通常无症状，然而约30%的患者表现出某些症状，仍可提示亚临床甲减的存在，如皮肤干燥(28%)、记忆力差(24%)、反应迟钝(22%)、肌无力(22%)、疲乏(18%)、肌肉抽筋(17%)、畏寒(15%)、眼睑水肿(12%)、便秘(8%)、声音嘶哑(7%)。因手术、放疗等原因所致的甲减一般无甲状腺肿大，而其他原因所致者常伴甲状腺肿大。

如抑郁、记忆力下降、认知障碍和多种神经肌肉症状等在亚临床甲减患者中多有发生。还可表现为骨骼肌异常，包括血清肌酸磷酸激酶(CPK)和乳酸升高等。尽管甲状腺功能正常，亚临床甲减的孕妇的后代智力发育仍然减慢。

心肌密度测定发现心肌存在异常，静息和运动状态下，亚临床甲减患者的心肌收缩和舒张功能轻微受到影响；在运动负荷下，心输出量、大动脉最大流量等下降。肺功能测定表现为肺活量下降等。亚临床甲减对心肺功能的影响较轻微，虽然与甲状腺功能正常者相比有差异，但是重要的是，这种差异是否产生严重的临床损害。

由于亚临床甲减往往是在体检时被发现，因此患者的检查结果常伴有血清总胆固醇(TC)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)升高，以及高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)降低，这些因素被广泛地认为是心血管疾病的危险因素。可表现为血管内皮功能异常，如血流介导和内皮依赖的血管舒张功能受损。

部分亚临床甲状腺功能减退症者可伴有血脂异常、缺血性心脏病引起的相应的临床症状，如皮肤脂肪粒、胸痛等。

亚临床甲减可引起流产，导致不孕不育。

亚临床甲减患者的心肌收缩和舒张功能轻微受到影响，长期可形成心包积液。

亚临床甲减可以引起抑郁、记忆力下降、认知障碍和多种神经肌肉症状等。

亚临床甲减往往伴有血清总胆固醇(TC)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)升高，以及高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)降低。

肌肉收缩与松弛均缓慢延迟、常感肌肉疼痛、僵硬、骨质代谢缓慢、骨形成与吸收均减少、关节不灵、有强直感、受冷后加重。