1、首先创建（打开一个项目文件），将准备好的Si.cif（Si的结构文件）和SiO2.cif（SiO2结构文件）拖入左边的文件栏中。

2、分别右键两个文件的黑色空白区域，选择Display style选项

将左侧的Display style栏内的“Ball and stick”勾选，然后关闭对话框。可以将两个结构文件的显示都改为球棍模型。

3、在搭建界面、多层结构之前，我们需要了解各个结构的晶格参数，选择形状相似、大小相近的晶胞面进行堆叠、接触。比如这两个结构，我们将其用Vesta可视化出来。可以从下方的信息栏中得出：Si的a=b=4.95458Å，c=7.31134Å；而SiO2的a=b=c=5.44370Å，则可以选择Si晶胞的ab面和SiO2的ab、ac、bc三个面中任意一个面相接触来构建新的结构，因为都是正方形且长度差距不大。

4、选择好了接触面，开始在MS里进行构建多层结构的操作，在项目上方菜单栏选择Build—Build layers

首先选择两个结构分别作为Layer 1和Layer 2，然后切换到Matching，新的晶格参数选择Average，避免任一晶格拉伸过度。然后直接点击设置框下方Build按钮。即可构建出新的双层（多层）结构。

5、将新建的结构调制侧视图状态，然后点击如图所示按钮：“Calculate Bonds”，可视化原子之间的化学键。

6、到这里还不够，如果需要层间成键，可以适当调节层间距。选择上方的SiO2部分，并选择红线圈起的Movement按钮，

Distance是直接设置移动的距离，单位是Å（埃米）；而Screen设置的是相对显示窗口大小的百分比位移。

我这里设置了  1Å/次  的移动频率，向下移动了两次，再次Calculate Bonds，可以看到层间已经出现了化学键。到这里就完成了层间存在化学键的界面/双层结构的搭建。