蛋白酶K使用常见问题解惑

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蛋白酶K使用常见问题解惑

2024-06-15 10:08| 来源: 网络整理| 查看: 265

        蛋白酶K在新冠期间一战成名,从此走进了大众视野,然而在这之前的知名度却远不及它所发挥的作用,其实在科研研究中,蛋白酶K一直是十分重要的存在。希望本文能帮助到在科研中对蛋白酶K的使用有问题及疑惑的小伙伴们,期待共同进步!

一、蛋白酶K的贮存液浓度、常用工作浓度一般为多少?最佳PH范围是多少?干粉蛋白酶K如何配制?

·蛋白酶K贮存液的浓度一般为10 mg/mL或20 mg/mL。

·常用工作浓度为50-100 μg/mL,需根据所用缓冲液是否含有SDS、尿素、pH是否适合、温度是否适合等因素确定具体的工作浓度。常用浓度的EDTA、Triton X-100、Tween 20、Sarkosyl、盐酸胍对蛋白酶K的活力影响不大。

·最佳PH范围为7.5-8.0。

·干粉蛋白酶K配制推荐溶解缓冲液为50 mM Tris-HCl(pH7.5),10 mM CaCl2,配制时需轻轻摇动,直至蛋白酶K完全溶解,不要涡旋混合,过滤除菌后分装成小份贮存于-20℃。

二、为什么RNA提取中需要用蛋白酶K呢?

  因为核酸常常与蛋白质相结合,提取时,蛋白质降解不完全,核酸就无法被分离变成游离形态,那么核酸提取效率和回收量就会大大减少,从而影响实验效果。我们都知道RNA的质量对于Northem印迹及杂交分析、cDNA合成及体外翻译等实验的成败至关重要。而RNA极不稳定、易于被广泛存在的RNase(RNA酶)降解,因此利用蛋白酶K创造一个无RNase的环境、严格防止RNase污染是成功提取RNA的关键。这里提醒科研工作者选择纯化质量高,不含DNase和RNase的蛋白酶K产品,更有利于各种核酸的高效提取。经费足够的话,可以选择美国Amresco公司的0706蛋白酶K,效果不错;考虑性价比可以选择国内的Starvio蛋白酶K,因为相较于市面上蛋白酶K≥30U/mg的比活力,Starvio的比活力可达到≥35U/mg,这是非常难得的。

三、实验样本为痰液,想要提取核酸,需要用蛋白酶K处理吗?

  推荐使用,因为痰液样本本身复杂,使用蛋白酶K处理后可以使核酸更易释放出来,继而提高核酸提取的效率。为了验证蛋白酶K在核酸提取中的作用效果,我们实验室曾进行过痰液RNA提取实验,一组用Starvio蛋白酶K处理,另一组用磷酸盐缓冲液(PBS)处理,每组设置5个样本,其它实验条件保持一致的情况下,将两组实验所提取的RNA,分别进行qPCR检测。结果显示,PBS处理法的CT值范围为33.4-38.0,而Starvio蛋白酶K处理组的CT值范围在28.1-32.3之间,相比之下,Starvio蛋白酶K处理组早了好几个循环。

        一些复杂样本如痰液、粪便等,其中往往存在着可抑制PCR反应的物质(糖蛋白、免疫球蛋白等),使用了蛋白酶K可最大程度清除该类物质;同时,这些样本中容易残留较多RNA酶,使用蛋白酶K可最大程度灭活RNA酶,防止病毒RNA的降解,提高RNA回收率,保证PCR结果准确性。

四、能否举例说明蛋白酶K加少加多了会怎么样呢?

Ø [蛋白酶K加少的影响:在DNA提取中,蛋白酶K的主要作用就是水解蛋白质的可以将蛋白质与DNA很好的分离。如果蛋白酶K的含量少的话就会影响蛋白质的水解程度,导致提出的DNA含量和纯度都会受到影响。

Ø 蛋白酶K加多的影响:蛋白酶K在原位杂交技术中通常用于杂交前的样品处理,它具有消化包围靶DNA蛋白质的作用,能增加探针与靶核酸结合的机会,提高杂交信号。但蛋白酶K的用量过多、浓度过高、消化时间过长或孵育温度过高时,都会对细胞的结构有一定的破坏,导致组织切片的脱落,细胞核的消失,从而影响杂交结果。

五、蛋白酶K在使用过程中要注意什么?

(1)蛋白酶K的最佳反应温度为65℃,但在65℃或更高的温度蛋白酶K自身的也非常迅速地降解,因此推荐反应温度50℃-55℃;

(2)Ca2+可以保护蛋白酶K不会自我降解、增加蛋白酶K的热稳定性、调节蛋白酶K的底物结合位点;

(3)配制好的蛋白酶K溶液分装保存于-20℃,避免反复冻融,以免酶活力下降;

(4)干粉蛋白酶K易受潮,注意密封于4℃储存保存。



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