南京医科大学第一附属医院擅长康复医学科、变态反应科、体检科、风湿免疫科、泌尿外科，上述科室是国家临床重点专科，患者可根据自身的具体情况选择合适的科室就诊。

在复旦专科声誉榜中位列第三，是国内三级甲等综合性医院中临床规模最大、设备最为齐全、技术实力最强的科室之一，也是国内成立最早的康复医学学科之一。在重症康复、老年康复等方面技术领先。

科室一直将变态反应作为研究的重点，学科主要收治各类变态反应性疾病，针对性地进行过敏原特异性免疫治疗。为江苏及周边地区的过敏性疾病患者提供了高水平的专业化医疗服务，得到学界同行的高度评价，在病患中享有很高声誉，是国内变态反应学领域的一支重要力量。

以医院雄厚的综合实力为依托，集萃丰富的医疗、保健经验和一流的人才、技术优势，能够为社会各界提供全方位、多层次、高品质的健康管理和健康促进服务。以医院国家和省级重点检验、影像科室为支撑，为受检者体检结果的准确评估提供强有力的保障。

是省内最早成立的风湿免疫病专科之一，是集医疗、教学、科研为一体，兼顾健康教育的著名风湿病学专科。在疑难及危重风湿免疫病救治方面有丰富经验，救治水平居省内乃至全国领先。

是一个集医疗、教学、科研于一体，学科规模、专科设备、技术水平国内一流的现代化学科。形成了以微创技术为特色，以普通泌尿外科、男科和肾移植为三大支柱的学科结构，多项技术达到国际领先或国际先进水平。