【R语言】

2024-07-10 17:37| 来源: 网络整理| 查看: 265

一、前言 1　热图介绍

通常，热图是对所获得的数据或其他因素进行归一化处理后，用颜色的变化来直观表示不同样本间的变化情况。本质上其是由一个个用预设颜色表示数值大小的小方格组成的数据矩阵，并通过对因子或样本的聚类，观察不同样品数据间的相似性。

2　热图绘制方式

常用的绘图软件：origin，excel，Tbtools，GraphPadPrism

R语言绘制聚类热图的R包：pheatmap，heatmap，corrplot，complexHeatmap

其中，pheatmap是R语言中使用最广泛的用于绘制聚类热图的绘图包。使用该绘图包可以帮助我们快速生成包含聚类结果的热图。

二、用pheatmap包绘制聚类热图 1 数据准备

数据输入格式（csv格式）：

2 R包加载及数据导入 #下载包# install.packages("pheatmap") install.packages("RColorBrewer") #加载包# library("pheatmap") library("RColorBrewer") #加载绘图数据# data

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