Omicshare在线课堂59期 |
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但目前,我们似乎还缺乏一期在线课堂将这些知识系统讲解一遍,于是我们的omicshare课堂第59期就有了——《QTL定位的方法与实操实现》。 在这一期课堂,我们将主要谈一谈与QTL分析相关的基础知识,包括 (1)QTL分析的基本原理 讲讲QTL这个概念的含义,以及QTL分析如何从单标记分析过度到线性回归模型。 (2)所需材料与数据 QTL分析简单说来,需要4大要素,包括: ①作图群体 ②遗传连锁图谱 ③标记基因型 ④表型数据 在4大要素的选择上需要注意哪些问题,这在我们实验设计阶段是需要提前想清楚的。 (3)复合区间作图算法与关键参数解析 目前QTL分析最常见的模型还是复合区间作图(Composite interval Mapping,CIM),尽管这个模型已经被提出近30年了。我们将从更简单的线性模型——区间作图(Interval Mapping,IM)讲起,由浅入深讲解复合区间作图的原理、计算过程与关键参数。即使你不是数量遗传学科班出身,也能做到“不但知其然,也知其所以然”。 图2 有时候冰冷模型加一点点大白话的解释,将会简单许多 (4)Omicsmart平台实现QTL分析; 理论联系实践,除了介绍几款QTL定位常见的软件(包括:winQTL cartographer、 MapQTL、Icimapping 和 R/QTL),这些软件各有优缺点。我们还将介绍使用基迪奥最新开发的基于Omicsmart在线分析平台轻松实现QTL分析。 图 3 常见图谱分析软件比较 Omicshare在线课堂59期《QTL定位的方法与实操实现》 课堂时间:2018年11月22日,下午4点; 讲解人:周老师 拓展阅读返回搜狐,查看更多 |
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