荧光定量 PCR,扩增曲线或溶解曲线异常怎么办?

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荧光定量 PCR,扩增曲线或溶解曲线异常怎么办?

2023-07-24 18:29| 来源: 网络整理| 查看: 265

qPCR 曲线异常问题通常分为两大类:扩增曲线异常、融解曲线异常。

扩增曲线异常

这个问题可能涉及到多种原因,主要可以归结为以下 6 种:

(1)扩增曲线不光滑

主要有两个原因:

一是扩增信号太弱,经系统矫正后,就产生这样抖啊抖的线,小编建议大家提高模板浓度重复实验。

二是仪器本身的问题,可能在扩增过程中仪器出现了波动或者本身该检测孔出现了异常。

(2)扩增曲线断裂或下滑

比较典型的曲线下滑如上图所示,主要原因是模板浓度太高了,在基线期内就起峰了,仪器会默认起峰的线条仍为基线部分,将扩增曲线往基线位置下拉,因此你的曲线就趴下来啦~

这种情况大家也不要慌,可以减小基线终点(例如基线期默认 3 - 15 个循环,改为 3 - 10 个循环),重新分析数据,一般都能得到一个比较好的结果。

(3)个别扩增曲线骤降

这是比较常见的一个问题,反应管内若留有气泡,温度升高后会导致气泡破裂,使仪器检测到的荧光值突然降低。所以大家进行扩增反应之前,一定要仔细检查反应管内是否有气泡残留。

(4)扩增曲线呈锯齿状且不连续

这个可以参考上图,这是典型的 ROX 添加不当导致的异常结果,曲线杂乱。大家首先可以尝试去掉 ROX 分析数据,看一下重复性是否 OK(复孔间 STD



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