图1 不同帽类似物化学结构

二、mRNA帽结构分析方法汇总

目前，荧光标记或凝胶电泳等简单方法可对mRNA大小和定性降解谱进行基本分析，并且可以与酶消化相结合以探测特定的序列特征。另一方面，纳米孔mRNA测序提供了详细的核苷酸水平样品评估方法。如图 2所示，为现有5' Cap分析技术的汇总图。

图2 现有5' Cap分析技术汇总图

2.1 电泳法

长链编码RNA通常由成千上万个核苷酸（nt）组成，而加帽与未加帽的mRNA仅相差一个甲基化鸟苷（m7G），这一微小的差异导致其在全长mRNA中难以区分。当前加帽率的检测思路为：通过酶切获得5’端RNA片段（长度约几十个核苷酸），随后通过聚丙烯酰胺凝胶、液相色谱（HPLC）或液质联用（LC-MS）等方法分离不同长度的5’端寡核苷酸片段，从而定量评估mRNA的加帽率。

使用RNase H将长链RNA分子切割成短片段（