绘制UpSet图的在线神器：再也不用担心韦恩图画不下啦~ |
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绘制UpSet图的在线神器：再也不用担心韦恩图画不下啦~
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最近，日常工作中经常时不时听到一些疑问，我们在日常科研中可能被5组韦恩图魔咒环绕，困扰不已。那么，福音来啦，咱们联川云平台OmicStudio的在线云工具UpSet图来啦。接下来就让我们一起来看看，到底是何方神圣如此强大。 UpSet图-云平台网址：https://www.omicstudio.cn/tool/43特色功能一睹为快1.输入数据：3种格式类型； 2.高级功能一：图表对应，计算overlap并下载； 3.高级功能二：支持分组（新增） 4.高级功能二：柱状图排序方式调整； 5.高级功能三：是否显示原始数量/交集数量/venn圈图； 6.优化调整：颜色；标题；字号 ……等 upset展示图介绍接下来，噔噔噔噔，一起来认识一下upset的真面目：  Upset展示图的主要内容可分为3部分：（1）左侧柱状图展示各原始数据集中包含的元素总量； （2）下方交集点的部分，通过横向的对应关系，用点指代左侧的对应数据集名称。通过纵向实现点与点之间的连接，来表示对应数据集之间存在交集的情况。即，通过点与点之间的连接，对应传统韦恩图中圈与圈的重叠。 （3）通过纵向的对应关系，对应上方柱状图，表示该交集情况下的交集元素数量。 云平台功能介绍 3种常见输入文件格式，供您任意选择 在upset基本图形上叠加直观的圈图，可要也可不要，想放哪里就放哪里，就是这么任性  光画图就好了吗？那当然不是，我们要给您更好的服务。想查什么信息，您想要的，这里都有： 什么？样本需要分组，展示分组后的交集情况？手动整理分组后文件太麻烦啦！不用担心，您想要的我们都帮您实现，最新更新支持分组啦。 图画完了，下载PPT。天哪，它……竟然可以拆分组件，堪比图片编辑器。 好了好了，赶紧去联川生物云平台试试去。有什么问题，可以通过云工具界面右侧的问题反馈来告知我们哦。  致谢让我们给生信前辈大神们致敬，比如在此感谢大名鼎鼎的Y叔叔，请收下小侄（迷）女（妹）们崇拜的追随目光。感谢前辈对于经验和技能的无私分享（转UpSet图为ggplot?）（微信稿链接：https://mp.weixin.qq.com/s/g6rRGhtKQd_mdRMKxteNVw）。本着继续发扬这样的精神，和为广大科研工作者尽心服务的宗旨，我们联川的云平台工程师在新版的upset绘图包基础上，结合前辈的分享的经验，将这个进阶版的venn图展示工具——upset绘图，搬到了我们的联川生物云平台上。广大科研工作者，可以在我们的云平台上免费进行使用。 参考文献【1】Lex A, Gehlenborg N, Strobelt H, et al. UpSet: visualization of intersecting sets[J]. IEEE transactions on visualization and computer graphics, 2014, 20(12): 1983-1992. 【2】Conway J R, Lex A, Gehlenborg N. UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties[J]. Bioinformatics, 2017, 33(18): 2938-2940. 【3】https://mp.weixin.qq.com/s/g6rRGhtKQd_mdRMKxteNVw 【4】https://github.com/GuangchuangYu/yyplot 更多超好用的在线生信云工具的详细教程资料： |
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