利用R绘制venn图（VennDiagram、eulerr、venneuler、limma） |
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利用R绘制venn图（VennDiagram、eulerr、venneuler、limma）
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最近对利用R绘制venn图进行了一些学习。参考了网上很多资料： 【R作图】在R中绘制韦恩图的几种方法 和 一些漂亮的venn图如何使用R来绘制韦恩图（Venn Diagram）venn.diagram: Make a Venn Diagramhow to add legends and values in a Venn diagram using R (VennEuler package)?另外再推荐一个在线绘制venn图的网站（除了广告较多都挺好的）：https://www.meta-chart.com/venn 具体包括下面三个包： limma、venneuler、VennDiagram。总的来说，三个包都有着各自的不足。下面会一一进行说明，这里先放上结论：综合方便程度以及函数的多样性而言，VennDiagram > venneuler > limma。 limma首先针对limma包，输入下两行就可以直接进行安装： source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("limma")虽然只用输入两行，但是运行之后你就会发现，依赖包需要安装到地老天荒，海枯石烂，花儿都谢了。（而且还可能安装失败） （我们这里假设安装成功 之后利用vennDiagram()按照指定的用法就可进行venn图的绘制了，但这个包有一个很大的局限，就是最多只能够绘制3个集合，一旦超过就无法继续绘制了，而且绘制的效果也比较丑，如下所示。（由于实在没有安装成功，这里参考了网址：venn: Venn Diagrams） 接着是venneuler，这个包绘制出来的图案就比上一个包要漂亮了许多，如下图所示： vd |
实在不符合审美，我们进入下一个包。【本文地址】