但这时的重庆百业凋敝、敌特猖獗、物价飞涨，对重庆的困难，中央是有预见的。1949年7月17日，中央决定成立以邓小平为第一书记的中央西南局；同年12月3日，重庆市军管会成立。

邓小平主政西南不到3年，重庆经济就超过抗战最鼎盛时期。”生产恢复后，重庆的工业品源源供给西南五省区，并为抗美援朝生产了大量军工产品。

1949年的最后一天，在邓小平主持的西南局常委会上，成渝铁路被提上议程。当邓小平赴京向毛泽东请示时，毛泽东答：你能说服我，我就鼎力相助；若说不服，那就暂时搁置。

面对雄才大略的毛泽东，睿智的邓小平用了三招，“第一招，邓小平说，四川交通闭塞，政令不畅，古人云：天下未乱蜀先乱，天下已治蜀未治。四川作为西南首省，不修铁路不利于政令畅通。此其一。”“其二，重庆、成都是西南中心城市，如修铁路，不仅可以带动四川乃至西南百业兴旺，还可以向全国提供优质大米、猪肉、禽蛋和副食品，互通有无。此其二。第三，中国人还从未自己设计施工建铁路，如成渝铁路修成，既可提高我国际声望，也可使大大小小的工厂订货充足，加快工业发展，有百益而无一害焉。”

这三招让毛泽东下定决心：“修成渝铁路！”1950年6月15日铁路开工；1952年7月1日，全长505公里的“新中国第一路”建成通车了，成渝两地欢声雷动。除铁路外，第二次直辖还至少给重庆留下三座地标：市人民大礼堂、大田湾体育场、市劳动人民文化宫。

而重庆第二次直辖市历程直到1954年7月，分局制度取消，西南大区、北碚市并入重庆后结束，重庆从直辖市降为副省级市，重庆与四川合并。

1994年秋天，当时分管民政工作的国务委员李贵鲜召集开了一次会。会上，李贵鲜说，党中央、国务院领导要他们论证设立重庆直辖市的可能性。他强调，要大家只做不说，必须严守国家机密。1995年，李贵鲜等一行4人开始去重庆调研。

据介绍，中央设立重庆直辖市的原因，主要基于三个方面的判断：一是四川省人口过多，是中国管辖县级以上行政区域单位最多的省；其次，是为了便于三峡工程建设的统筹管理；再者，重庆是长江上游最大的城市，成立直辖市可以充分发挥其中心城市辐射作用。

历时2年多的调研，他们先后提出了4个方案。一个方案是以三峡库区为中心建立一级政区，成立省或者直辖市，包括湖北宜昌，但后来觉得牵涉地方太多，不能精简效能，中间管理成本过高，放弃了；第二个方案，把万县、涪陵和黔江等划过来外，还包括广安、达川等也拿过来，但后来想，这么多贫困地区拿过来，重庆负担过重；第三个方案，就是直接把重庆地区升格为直辖市，这个办法得简单，不过无法解决三峡库区移民的问题，只能放弃。

于是便有了第四个方案，即现行的重庆市区划。据相关人士回忆，虽然调研非常低调，保密工作做得也不错，但1996年的春天，香港的报纸还是发布了消息——内地准备设立重庆直辖市，甚至连区划示意图也刊登出来。这让调研小组的工作显得很被动。有关方面第二次赴渝便是为了查实泄密事件。很快，事情水落石出，原来是当地一家地方报纸的负责人走漏了消息。幸运的是，泄密事件没有影响到重庆直辖的进程。

1997年3月14日，第八届全国人民代表大会第五次会议投票表决通过了《关于批准设立重庆直辖市的决定》。

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