无单一的检查方法被一致接受。很多临床医生不做任何检查（甚至不做尿液分析）就对有排尿不适、尿频、尿急但无报警发现的健康女性按推定的设想使用抗生素治疗膀胱炎。其他医生对每人收集清洁中段尿标本做尿液分析和尿培养检查。建议对具有多重耐药菌感染危险因素的患者进行尿培养。有些医生在试纸法检查发现白细胞（WBCs）时才予以尿培养检查。在育龄妇女，需做尿妊娠试验（妊娠期的尿路感染需引起注意，因为它可增加早产或胎膜早破的风险）。出现阴道分泌物需行湿涂片检查。许多临床医生定期获取宫颈（女性）或尿道（男性）分泌物样本进行STI检测（淋球菌和衣原体培养或聚合酶链式反应[PCR]），因为许多感染患者没有典型的表现。

尿培养结果>105细菌集落形成单位（CFU）/mL，提示细菌感染。在有症状的病人中，有时低至102～103CFU/ml也提示感染。培养结果阴性但存在白细胞是非特异性的，可提示性传播疾病感染、外阴阴道炎、前列腺炎、结核（TB）、肿瘤、间质性肾炎或其他原因。尿白细胞阴性、尿培养阴性，但尿红细胞阳性，可能由于癌症、结石、异物、肾小球疾病或近期泌尿系器械置入。

膀胱镜及泌尿系影像学检查适用于梗阻、解剖学异常、癌及对抗生素治疗无反应的、有反复发作症状的及非感染性血尿的病人。 反复发生下尿路感染 或多重细菌感染的男性应考虑复发性直肠膀胱瘘。妊娠病人、男性、老年病人及有长期或反复发作表现的病人需要密切关注及更详细的探查。