利用Evolview美化进化树教程和使用方法 |
您所在的位置:网站首页 › 进化树制作方法 › 利用Evolview美化进化树教程和使用方法 |
前面给大家推荐过Evolview,推荐一款强大的进化树编辑软件,今天给大家详细介绍如何使用这个在线工具,教你如何绘制高颜值的进化树。 1.Evolview简介 Evolview可在线进行系统进化分析,简约而不简单。能够标注较复杂的注释信息,可导出多种格式的文件,包括pdf、svg、tiff、png,而且绘制完成的进化树可永久性的保存在网站里,也可进行共享。心动了吧,那快猛戳这里,http://www.evolgenius.info/evolview 根据小编的经验,建议各位使用 Google 浏览器,用其他浏览器导出的文件可能会不完整。 首先,我们要注册账号,见下图: 2.输入文件准备 需导入Newick、NHX、PhyloXML和Nexux等格式的纯文本文件(plain text files),比如MEGA等软件输出的Newick文件,见下图:
3.进入操作界面 工具栏包括基本设置、高级设置、添加注释信息和导出文件。网站首页有17个DEMOS和5个SHOWCASES供大家参考学习: (1)导入文件 (2)设置分支颜色 格式:location,color,commands,共三列,由制表符分隔。 location—一个叶节点,或者由逗号分隔的2个叶节点 color—颜色的名称 commands—控制命令(可不设) 示例: 控制命令说明: ad—应用到所有分支和叶节点 prefix—应用到以第一列字符起始的所有叶节点上 suffix—应用到以第一列字符结尾的所有叶节点上 anywhere—应用到包含第一列字符的所有叶节点上 toroot—应用到从叶节点到根节点的所有分支上 (3)设置标签及其背景颜色 命令格式与设置分支颜色类似 (4)设置标签装饰 格式:location shape,color[:stroke_color] 至少有2列:由制表符分隔。可以设置多列,格式和作用与第2列相同,即一个标签可以设置多个装饰图形。 形状类型:triangle(三角形)、circle(圆形)、rect(矩形)、star(星形)、check(勾形) location—一个叶节点的名称 shape,color[:stroke_color]—装饰形状(shape),填充色(color),边框色(stroke_color)。 注意:勾形只能为纯色。 (5)设置分组标签
格式要求: 设置语句含2列,以制表符分隔。 location—一个叶节点,或者由逗号分隔的2个叶节点 label—颜色的名称设置文字标签(text=label,必须)和格式参数(color可选) 2种格式参数设置方式: 全局参数—以“!groupLabel”起始,放在第一行,作用于所有语句 局部参数—放置在每条语句后,只作用于当前语句,且局部参数会覆盖全局参数。 格式参数列表
示例: (6)设置Bootstrap值(注:进化树必须含有bootstrap值) 格式要求: 设置语句含2列,以制表符分隔。 bootstrap值范围—一个值,或者由逗号或冒号分隔的2个值 bootstrap值的显示格式参数 2种格式参数设置方式: 全局参数—以“!bootstrapValueStyles”起始,放在第一行,作用于所有语句 局部参数—放置在每条语句后,只作用于当前语句,且局部参数会覆盖全局参数。 (7)个性化设置 在图中添加柱状图、热图、点图、箱线图等。 可点击进入帮助页面查看详情,见下图。 最后,高颜值的图就诞生啦! |
今日新闻 |
推荐新闻 |
CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3 |