师妹过来说：“转录组的文章投出去了，但是期刊编辑部发邮件索要登录号。怎么把自己的转录组数据提交到NCBI啊？” 还好上个月刚刚新提交了一批数据，“教程给你，自己操作吧”

由于NCBI页面的改版，网上的大量教程已经不够准确，即使是2020年的教程，很多内容和页面都已经改变。本文将一步一步详细介绍在windows系统下高速上传数G体量的数据到NCBI的流程。（2021年2月版）。

在NCBI注册个人的账号，并登陆。注册时候，最好是有一个教育网的邮箱

打开NCBI主页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，并点击submit。

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页面打开后，向下拉找到SRA，再点击submit。

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进入my submissions页面，底部列表中可以看到过往提交的内容以及当前处理状态，没完成的任务也在里面。点击new submit。

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如果第一次提交数据，系统先提醒认证个人信息，其中邮箱需要两个，在过去要求有一个必须是教育网edu的邮箱，现在似乎没有这个要求了。如果该账号以前提交过数据，那么系统会确认提交者个人信息是否正确并分配任务编号。检查无误后，继续continue。

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为了节省信息填报时间，项目和样品信息这里可以选NO，这些信息系统可以自动生成。数据release date按个人需求大概填写，该日期在数据提交完后还可以修改。继续continue。

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带*的Project title 和description 简单填写。Relevance根据自身研究内容选，我的数据是农业相关。其他内容暂不管。继续continue。

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这里的样品类型关系到后面需要下载和填写的信息，要看清楚。我的是植物样本，直接选了plant，继续continue

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需要填写的信息较多，最好是本地做好表格再上传。先download 模版，按要求填好后再上传。注意：organism的拉丁名一定要写对，否则可能需要至少2天才能改过来（据说需要NCBI人工修改，本人暂未遇到过）。如果不确定名称，可以去NCBI中搜索，确保准确。注意：每个样品不是依据样品名称的差异来区分的，而是利用多个属性组合把每个样品区分开。所以不能仅仅是样品名称不同，其他属性都相同，应该能填的属性多填几个，保证样品之间总有某个或多个属性不同，这样就能区分样品。具体填写可参考我的表格。如果上传不成功，系统会给错误提示。报错后，删除旧表，修改信息，重新传（据个人经验，网络正常情况下，表格上传后，如果系统很久没有进入下一个页面，出现类似于卡住的现象，很可能就是填写的信息不符合要求）。上传完就continue。

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先下载模版，填好后上传。表格项目比较多，先看sheet1里的说明，然后再填SRA_data表中的信息。样品名称要和上一步表格中一致。可参考我的表格，我的是ILLUMINA平台双端测序的转录组数据，每个样品有两个压缩数据包，分别是1和2，填在filename和filename1栏中。

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对于数以G体量的数据，最好选用Aspera高速上传的方法。注意Aspera command line upload instructions中包含的上传命令（红框中命令上传时候需要用到）。点击key file，下载得到aspera.openssh（上传需要用到）。接下来就是上传数据，数据上传完后，点击Select preload folder，选择你的数据文件夹。才能continue。

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在windows上安装IBM Aspera Connect软件，注意名称中包含connect，不要下载错。自行搜索，或去下载地址https://www.ibm.com/products/aspera/downloads。

点击windows开始处，输入cmd，启动DOS。然后利用cd命令切换到aspera的可执行文件所在的目录。

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执行上传命令：ascp -i 已下载的aspera.openssh的目录 -QT -l100m -k1 -d 拟上传数据所在的文件夹目录 [email protected]:uploads/自己命令的内容/data(自己新建文件夹名字，上传完后要选择这个文件夹)/

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所有数据上传完后，点击NCBI 网页中的Select preload folder，选择自己新建的文件夹名字。然后continue。

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最后整体检查一下所有表格和数据内容，没问题就submit。整个提交完毕，等待NCBI系统处理。可以在my submissions中查看处理进度。系统处理完后可以查看accession。

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点击manage data可以获取reviewer link，修改数据release date，编辑其他的信息等。

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