NGS 引物探针

文库构建相关引物

SanNGS UDI Adapters for IIIumina SanNGS UDI 接头引物（适用于 IIIumina）

本试剂盒是适配 IIIumina 高通量测序平台文库构建的接头试剂盒，包含两种组分，其中 Adapter 用于末端修复 tail A 之后DNA 或者 cDNA 的连接反应；index 引物用于后续扩增文库，文库经过长度分选之后，即可上机测序。该本试剂盒 index 采用主流的 8 碱基双端唯一（也称 UDI）接头，可以有效防止 IIIumina 平台标签跳跃（index hopping）现象导致的数据交叉污染。本试剂盒可满足多样品 IIIumina 文库构建，试剂盒内的组分经过严格质控，尽可能地降低了交叉污染比例，可以最大限度尽力保证文库构建过程的稳定性及可靠性。

特点：

Adapter 序列更短些，结构更稳定；

DNA 连接产物可以通过少数几个 PCR 循环，快速获得新 index 组合文库。当文库出现 index 重复的时候，只需要将其中一个文库的连接产物更换 index 引物重新扩增 8～10 个循环即可快速获得新的 index 文库，几乎不耽误测序进度。

靶向捕获相关引物

SanNGS Universal Blocker for IIIumina TruSeq Library SanNGS 通用 Blocker 引物（适用于 IIIumina TruSeq 文库）

SanNGS 通用 Blocker 引物（适用于 IIIumina TruSeq 文库）在进行液相探针杂交捕获时使用，可有效阻断 Adapter 之间相互结合，提高探针捕获的特异性和中靶率。如果不添加 Blocker 引物，液相 DNA 杂交捕获过程中，极有可能形成杂交结构。Blocker 的主要作用就是阻止上述结构的形成，从而提高捕获中靶率。

特点：

阻封效能高，价格低；

不需要一对一的添加，可以一对多使用，主要是阻封 IIIumina TruSeq 系列双端 8 碱基接头；

可接受定制。

全基因组扩增引物

Multiple Displacement Amplification Primers MDA 引物

MDA 技术即多重置换扩增技术，需要使用多种引物六聚体和 φ29DNA 聚合酶。引物六聚体先随机结合到 DNA 模版上，在φ29DNA 聚合酶调解下延伸，当遇到另一条新链随机引物时，φ29DNA 聚合酶替换引物，继续延伸，形成支链结构，新的引物和聚合酶会在支链上重新结合延伸，所形成的 DNA 片段一般为 50～100 kb。引物六聚体是由 6 个随机核苷酸组成的，用于扩增全基因组。

Degenerate Oligonucleotide Primed PCR Primers DOP PCR 引物

DOP PCR 技术即退化寡核苷酸引物 PCR, 是随机扩增得到全基因组序列的。该技术需要使用简并配对引物，即类脱氧肌苷引物，它可以结合到 DNA 任何部位。引物的 3' 端为 6 bp 退化寡核苷酸，5' 端为正常的碱基，引物中间部门含有 6 个随机碱基。3' 端和 DNA 链随机结合，最初几个循环退火温度要低（30°C 左右），然后延伸直到 5' 端引物配对处。

Multiple Annealing and Looping-Based Amplification Cycles Primers MALBAC 引物

MALBAC 技术即多次退火环状循环扩增技术，MALBAC 所用引物 5' 端为固定的 27 个碱基通用序列，3' 端 8 个随机碱基序列。

Primerextension Preamplification Primers PEP 引物

PEP 技术即引物延伸预扩增法技术，使用 15 个碱基长的随机引物（N15）, 在 37°C 的低退火温度下进行较长时间的退火，然后缓慢升温至 55°C 进行长时间的引物延伸，如此反复多个循环。