病原学检查是指使用各种方法检测人体内细菌、病毒、真菌以及寄生虫的感染情况。取材包括人体的血液、尿液、粪便、呼吸道标本、脑脊液与其他无菌体液、眼部及耳部标本、泌尿生殖道标本、创伤组织和脓肿标本。检查方法包括：1、直接显微镜镜检，在光学显微镜下观察病原体的形态特征。2、病原体特异性抗原检测，用已知抗体，借助各种免疫学方法，检测标本中未知的病原体抗原。3、病原体核酸检测，主要有PCR和核酸探针杂交技术。4、病原体的分离，培养和鉴定。5、血清学实验。