非法占用农民耕地由县级以上人民政府自然资源主管部门来管，限期拆除在非法占用耕地上新建的建筑设施，恢复土地原状并没收违法所得，可以并处罚款，对直接责任人员依法给予处分，构成犯罪的依法追究刑事责任。

　　《土地管理法》第七十五条

　　违反本法规定，占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等按照职责责令限期改正或者治理，可以并处罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

　　非法批准征用、占用土地罪的的情形主要以下几种：

　　1.非法批准征用、占用基本农田四十亩以上的；

　　2.非法批准征用、占用基本农田以外的耕地三十亩以上的；

　　3.非法批准征用、占用其他土地五十亩以上的；

　　4.虽未达到上述数量标准，但非法批准征用、占用土地造成直接经济损失三十万元以上；造成耕地大量毁坏等恶劣情节的。

　　找法网提醒，构成非法批准占用土地罪的判刑为：行为人犯非法批准占用土地罪既遂的，处三年以下有期徒刑或者拘役；致使国家或者集体利益遭受特别重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑。本罪主体是特殊主体，即国家机关工作人员，主要是指在各级政府中的主管人员，土地管理、城市规划等部门的工作人员。

　　法律依据：《中华人民共和国刑法》第三百四十二条

　　【非法占用农用地罪】违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。