GraphPad Prism 10 Curve Fitting Guide

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GraphPad Prism 10 Curve Fitting Guide

2024-07-10 10:58| 来源: 网络整理| 查看: 265

EC50的95%置信区间是不对称的 样本数据

不对称置信区间

上述样本数据已拟合到模型:[激动剂]与反应 -- 可变斜率凭借使用我们推荐的不对称(似然)方法将“置信度”选项开设置为计算置信区间。EC50的最佳拟合值(乘以106 转换成微摩尔)为2.4μM,95%置信区间范围为0.85μM至15.3μM.

Prism还会用对数刻度报告这些值。logEC50(log molar)为-5.62,95%置信区间为-6.07至-4.82。

需注意三个方面:

•置信区间相当宽。这是因为数据有一些分散,也因为我们拟合了EC50外加三个其他参数(顶部和底部稳定段和斜率)。如果将这些参数中的一个或多个设定为常数值,EC50的置信区间会变窄。

•用浓度刻度表示的置信区间是非常不对称的。

•用对数刻度表示的置信区间接近对称。

拟合数据的另一种方法是将X值转换为其对数,然后将转换结果拟合到模型中:log[激动剂]与反应 -- 可变斜率凭借使用我们一直推荐的不对称(似然)方法将“置信度”选项开设置为计算置信区间。用这种方法,会得到完全相同的结果。

对称的置信区间

Prism提供了两种计算置信区间的方法。上述结果是使用产生不对称区间的新方法计算。如果使用另一种方法(Prism先前版本中提供的唯一方法),拟合的参数的置信区间将始终对称。

如果拟合能与logEC50拟合的模型,置信区间范围为-6.07至-4.82。上文所示logEC50的“不对称”置信区间几乎是对称的,因此对称置信区间几乎相同(与三位数相同)。

但如果拟合EC50并要求对称的置信区间呢?在此情况下,报告的区间范围为0 μM至5.21μM。这似乎是不对称的,因为EC50 被限制为大于零。如果删除该限制,Prism将报告一个范围为-0.42 μM至5.21μM的的置信区间,为关于2.4μM的最佳拟合值对称。该对称区间在量化IC50的精确度方面做得很差。简单的事实是,不确定性是不对称的,且对称的区间可能非常具有误导性。即使把置信区间的负部分放在一边,它也包括从零开始的所有值,因此不能提供任何关于EC50实际上有多低的指导。这就是为什么我们建议您常规地选择不对称区间。

不要转换logEC50的标准误差

我们建议您始终要求Prism报告不对称的置信区间,而非报告参数的标准误差。参数的SE在量化精度方面表现不佳。涉及到对数时,它变得特别令人迷惑。一些人看到logEC50的标准误差时,他们很想通过逆对数将其转换成EC50的SE。这是无效的。

在本示例中,logEC50的SE为0.2158。0.2158的逆对数等于1.644。该值不是EC50的SE。不能解读为正/负误差值。它是一个乘以/除以误差值。如需得到等于logEC50加上或减去一的logEC50,通过EC50除以1.644找到下限,通过乘以1.644找到上限。但这种情况并不常见,因此如果试图用这种方式报告结果的话,会很混乱。

从几项实验中得出EC50的平均值

用logEC50表示剂量反应曲线的中点时,不确定性接近于对称,但用EC50表示时,不确定性通常不对称。因此,汇集几个实验时,最好对logEC50值取平均值,这将给出与EC50平均值不同的结果。

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