维生素B6主要包括吡哆醇、吡哆醛和吡哆胺，主要的活性形式是磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺，两者之间相互转换，在体内80%的维生素B6是磷酸吡哆醛，存在于肌肉当中。

维生素B6它不是直接起作用，是体内上百种酶的辅酶，其中磷酸吡哆醛是谷氨酸脱羧酶的辅酶，增进大脑抑制性神经递质γ氨基丁酸的生成，临床上使用维生素B6治疗小儿惊厥、妊娠呕吐、精神焦虑。磷酸吡哆醛也是血红素合成的关键酶的辅酶，维生素B6缺乏，可以造成小细胞低色素性的贫血。维生素B6也可以通过催化同型半胱氨酸降解的酶来降低高同型半胱氨酸血症，磷酸吡哆醛这种维生素B6的主要形式也可以终止类固醇激素的合成。

维生素B6缺乏的时候可以增加人体对雌激素、雄激素、皮质激素和维生素D作用的敏感性，与乳腺、前列腺和子宫的激素依赖性肿瘤发生、发展有密切的关系。维生素B6与其他的水溶性维生素不同，过量服用可以造成中毒，每天摄入量超过200mg以上，就可以引起神经损伤，表现为周围感觉神经病变。