核糖体结合位点（RBS）是mRNA分子5'（上游）的区段，能够结合核糖体正确定位至翻译启始位点。RBS能够控制mRNA翻译启始的准确度和效率。

在原核mRNA中，RBS位于起始密码子（即第一个AUG）上游7个核苷酸处。本序列也称为Shine-Dalgarno序列，是由位于AUG起始密码子5'端的多鸟苷酸序列AGGAGG所组成的。由于这一序列能够与30S核糖体亚基中16S rRNA的3'端实现互补，因此该信使RNA能够与核糖体高效结合。Shine-Dalgarno序列是必需的。

真核生物中的蛋白合成过程与这一模型不同。mRNA的5'端具有一个经修饰的化学结构（“帽”结构），能够被核糖体所识别，后者随之与mRNA相结合并沿着mRNA移动（“扫描”）直至找到第一个AUG密码子。碱基的特征模式（称为“Kozak序列”）有时在该密码子的周围被发现，以使人想起Shine-Dalgarno序列的方式帮助正确定位mRNA，但不与核糖体RNA形成碱基配对。因此，Kozak序列并非是核糖体结合位点，而是一个翻译启始增强子。保守的Kozak序列为G/ANNAUGG，其中的AUG表示起始密码子。-3位点的一个嘌呤（A/G）碱基具有显性效应；如果-3位点是一个嘧啶（C/T）碱基，则翻译进程会对-1，-2和+4位点的改变更为敏感。当-3位点从嘌呤变为嘧啶时，表达水平可能降低达95%以上。+4位点对于表达水平的影响较低，只发现有50%左右的降低影响。注意：酵母不遵循这一规则。果蝇中优化的Kozak序列会有些许的不同（C/AAAA/CAUG）。