细胞膜可将细胞内部与细胞外环境分隔开。其主要成分是蛋白质和脂质，在信号传导和维持离子稳态中发挥基础性作用。细胞膜是划分细胞边界的一种便捷标记物，因此，许多细胞膜探针被用于 HCS 检测中的自动分割。通常，亲脂性染料可作为细胞膜染料；但是，它们会迅速内化，从而仅有非常狭窄的窗口用于成像检测。荧光标记的凝集素（如小麦胚芽凝集素WGA）也被广泛使用，但其细胞膜染色结果在不同细胞类型间存在差异。

使用细胞染色模拟工具