一、原料不同：

1、红薯淀粉：是由蕃薯淀粉等所制成的粉末。

2、土豆淀粉：是由土豆，包括土豆皮，煮熟后，干燥并精细磨碎。

二、粘性不同

1、红薯淀粉：粘性比土豆淀粉要低，比玉米淀粉要高。

2、土豆淀粉：粘性比玉米淀粉和红薯淀粉都要高。

三、用途不同 

红薯淀粉：红薯食用加工的利用：如水果红薯、紫色红薯、烤红薯、红薯尖、红薯叶柄、粉丝、粉条、粉皮、薯干、薯条、薯饼、薯脯、紫薯等。

土豆淀粉：大型的染织布厂和造纸厂中将马铃薯淀粉添加到印染浆液；做为橡胶添加剂，可增强橡胶产品的强度、硬度和抗磨性等。

马铃薯淀粉解释：

马铃薯淀粉的黏度取决于其直链淀粉的聚合度。将马铃薯淀粉、敏枣贺玉米淀粉、燕麦淀粉和小麦淀粉进行糊浆黏度实验比较，实验研究得，马铃薯支链淀粉的含量高达79%以上，马铃薯淀粉峰值平均达2988 BU,比玉米淀粉(589BU)、燕麦淀粉(999BU)和小麦淀粉(298BU)的糊浆黏度峰值都高。

番薯淀粉与玉米淀粉一样，融于水中后加热会呈现粘稠状，而地瓜粉桥派的粘度较玉米淀粉更高，因此，在中菜勾芡时较少使用地瓜粉，因为粘度较难控制。 应用于中式点心制作较多，如山粉饺等。

以上内容参考：百度岩滑百科-马铃薯淀粉

以上内容参考：百度百科-番薯淀粉