特发性少精症病因不明，继发性少精症病因多明确，常继发于精索静脉曲张、染色体异常、畸变、隐睾等疾病。本病好发于生殖系感染、长期抽烟或喝酒、接触辐射或化学物质等刺激因素的中青年男性。

因睾丸温度的升高、毒素的逆流、内分泌紊乱等综合因素，使睾丸生精功能障碍而致少精不育。

特别是性染色体的畸变，可使精母细胞的减数分裂障碍，导致精子发生停顿。

隐睾时由于睾丸长期处于相对高温环境，胶原物质阻碍生精小管的透析作用，引起小管萎缩，造成少精或无精。

慢性生殖道感染不仅可蔓延到生精小管使生精功能减退，也可造成附睾管的部分阻塞而使精子数减少。

机体的自身免疫可影响精子的发生，使生殖细胞脱落，也可因睾丸网及附睾的自身免疫过程造成精子输出的阻断。

下丘脑-垂体-性腺轴功能的异常会影响生精功能，甲状腺及肾上腺的损伤也会引起本病。

由于某些物理及化学制剂的刺激可损伤生精上皮细胞，也可影响精子的发生。如物理辐射、化学杀虫剂、工业用品等。

多数化疗药物可抑制生精过程，引起少精。其他药物如麻醉剂、中枢性降压药、镇静药等也会对生精有一定的影响。

因患其他疾病需大量应用激素可造成精子数量下降，某些生殖系统的手术，如睾丸扭转复位术等也可引发本病。

一些全身性疾病，如结核、慢性肝病等可引起抵抗力低下，可引起少精症的发生，其他如糖尿病可导致少精症。

身体补充不足，缺乏蛋白质、维生素及微量元素等，可使睾丸生精能力受损，引起少精。

外部环境温度过高也会对睾丸生精功能产生影响，出现少精症。此外，环境污染物可影响人体内分泌系统，对男性生殖系统的影响主要表现在影响精液的质量。

研究表明长期接触此类危险刺激因素会干扰机体的免疫系统，引起精子数目下降。

长期的情绪刺激亦可使机体出现内分泌功能异常，诱发本病。

长期吸烟、饮酒在机体中残留的毒素及营养不良会致精液质量下降，进而诱发本病。

近年来，许多统计显示，患有少精症的男性人数呈上升趋势。男性精子质量的下降，折射出男士的健康状况不令人乐观。不合并其他精液质量指标下降的单纯少精症患者，在男性不育患者中占4%，属男性不育的常见原因。

本病常由静脉曲张、隐睾等泌尿生殖系统的原发病引起，所以患有精索静脉曲张或隐睾患者易发病。另外，部分长期营养不良及接触辐射等危险刺激因素的患者也易出现本病。