CGM 第94期:大数据在生物科学中的应用前景

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CGM 第94期:大数据在生物科学中的应用前景

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学术报告 CGM 第94期:大数据在生物科学中的应用前景——来自人类基因组学研究的启示

关键词:talks; Human genomics; Computational biology; Cloud computing

题目:大数据在生物科学中的应用前景——来自人类基因组学研究的启示 时间:美国中部时间 2020 年 5 月 13 日(星期三)8PM(北京时间5月14日 9AM) 地点:Zoom and Bilibili live stream 主讲人:李潇,北大信息技术高等研究院高级研究员,麻省理工与哈佛博德研究所计算生物学家,连续创业者,原人类基因型及组织基因表达计划核心成员。在中国农业大学获得生物化学学士学位,爱荷华州立大学遗传学获得硕士学位后,师从哈佛医学院著名癌症计算生物学家Gad Getz博士及著名人类遗传学家Daniel MacArthur博士。 中文摘要

高通量测序技术正在深刻改变生物学研究的模式,多组学相结合的序列分析方法,正在以史无前例的速度揭示基因组、功能基因组以及表观基因组水平上的模式和细节。海量的数据为生物学研究带来了巨大的挑战,传统的分析方法和工具不再适用。因此,开发更高效的统计算法和计算工具迫在眉睫。在本期的讲座中,我将介绍大数据分析的难点,包括数据存储、并行计算、数据混杂以及结果的可视化。最后,我将展望大数据在生物学领域的前景,着重介绍多组学数据的整合,数据的挖掘,生物学数据库的兴起,以及一些非常前沿的诸如区块链和人工智能等信息技术, 这将会促进生物学研究的发展。

关键词

Human genomics,Computational biology, Cloud computing

主讲人简介

李潇长期从事算法和统计方法的开发及其在医疗健康领域的应用和商业化运作。研究涉及机器学习、统计方法、自然语言处理、区块链、大数据处理、云计算和分布式计算等多个方面。开发的方法和软件在人类遗传学,基因组学,流行传染病,罕见遗传病,癌症以及电子健康病历处理交换等方面得到了广泛的应用,相关研究发表于Nature, Science,Nature Genetics, Nature Communication,Genome Research,American Journal of Human Genetics等多个重要杂志上。他在计算生物学、罕见遗传病与医疗数据交换领域创立的多家公司,已得到了麻省理工及哈佛大学相关机构的孵化。

李潇目前担任PLOS ONE,BMC Bioinformatics,Biomarker Research,Anti-cancer Drugs, Journal of Experimental and Clinical Cancer,American Journal of Molecular Biology,Biopreservation and Biobanking等多个杂志的审稿人。

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