黄河三角洲自然保护区位于山东省东营市的黄河人海口处，北临渤海，东靠莱州湾，介于东北亚内陆和江淮平原之间。 地理坐标为东经118°33′—119°207′，北纬37°35′—38°12′ ，包括黄河入海口和1976年以前引洪的黄河故道两部分。总面积15.3万公顷，其中核心区5.8万公顷，缓冲区1.3万公顷，实验区8.2万公顷。分为南北两个区域，南部区域位于现行黄河入海口，面积10.45万公顷；北部区域位于1976年改道后的黄河故道入海口，面积4.85万公顷。 

自然保护区的土地是黄河近百年来携带大量泥沙填充渤海凹陷成陆的海相沉积平原，地势平坦宽广，东西比降1：10000左右，潜水位小于2m，矿化度10～20ml/L，土壤为隐域性潮土和盐土土类，保护区是世界少有的河口湿地生态系统海岸线131km，黄河流经61km。黄河是我国第二大河，以含沙量高而著称于世，每年携带15亿t泥沙流向大海，在三角洲淤积了大面积新生陆地，平均每年新造陆地2000～3000ha，每年以3km的速度向渤海湾推进。这里水源充足，植被丰富，又因处于黄河流入渤海的交汇处，水文条件独特，海淡水交汇，离子作用促进泥沙的絮凝沉降，形成了宽阔的泥滩（即湿地），土壤含氮量高，有机质含量丰富，浮游生物繁盛，极适宜鸟类居集。以此为基础，吸引了大量过境和栖息繁殖的鸟类，同时，也提供了大片植物生长的土地，这片湿地保护区，其主要价值正在于此。