核酸鉴定方法之浓度/纯度及完整性鉴定 |
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核酸纯化在分子生物学实验室已经广泛应用。怎样获得高质量、高纯度的DNA或RNA样品对下游实验的顺利进行至关重要,因此,对纯化后的核酸进行鉴定也是必不可少的步骤。本文简单的回顾学习一下核酸鉴定的方法。 核酸鉴定包括:浓度/纯度鉴定+完整性鉴定 1.浓度/纯度鉴定 (1)紫外分光光度计: 原理:由于核酸中的碱基都具有共轭双键,所以具有紫外光吸收性质。核酸在紫外光谱区有一条典型的吸收曲线,其吸收高峰在260nm处,吸收低谷在230nm处。蛋白质在紫外区的吸收高峰在280nm处,所以核酸的紫外吸收光谱数据是鉴定核酸的重要依据之一。 由于核苷酸最大吸收波长为260nm,根据朗伯-比尔定律可计算出在波长260nm的紫外线下,1个OD值的光密度大约相当于50µg/ml的双链DNA, 40µg/ml的单链RNA。紫外分光光度法只适用于测定浓度大于0.25µg/ml的核酸溶液。 计算公式: dsDNA(µg/µl)=OD260x50x稀释倍数/1000 RNA(µg/µl)=OD260x40x稀释倍数/1000 纯净的DNA OD260/OD280=1.8,制备的样品DNA比值在1.7-1.9,若洗脱时不使用洗脱缓冲液而使用去离子水,比值会偏低,因为PH值和离子存在会影响光的吸收值。 当OD260/OD280< 1.7,表明蛋白质含量较高,可用利用酚、氯仿、异戊醇抽提,再用乙醇沉淀去除。 当OD260/OD280> 2.0,表明RNA含量较高。可用RNaseA消化后再进行纯化。 OD260/OD230的值,一般不小于2.0,若小于2.0,表明有碳水化合物、盐类或有机试剂污染。 实例:基因组DNA提取得率和纯度 FOREGENE Soil DNA Isolation Kit( DE-05511) 特点: 简便—无需研磨、无需低温操作。 快速—90min内完成操作。 安全—无需有机试剂。 本试剂盒处理各种来源土壤样本,获得的基因组DNA量和纯度见下表: 纯净的RNA OD260/OD280=2.0,制备的样品DNA比值在1.8-2.1 ,OD260/OD280比值会受到所用溶液PH值的影响,例如,纯化的RNA在PH=7.5的缓冲液中OD260/OD280读数在1.9-2.1之间,而在中性的水溶液中比值会偏低,可能只有1.8-2.0,这并不意味着RNA的质量变差,所以还需要做电泳检测。 OD260/OD280 |
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