16岁吃避孕药会不会导致不孕不育，需要根据避孕药的种类、是否正确使用进行分析。避孕药主要分为短效避孕药和紧急避孕药，正确规范的服用避孕药通常对人体无害，不会导致不孕不育；如果短时间内频繁使用紧急避孕药，有导致不孕不育的风险。

1、短效避孕药：由低剂量的雌孕激素组成，剂量相对较小，安全性相对较高。部分多囊卵巢综合征患者和月经不调的患者还可以在医生指导下，通过短效口服避孕药来调节体内激素水平，在停止使用短效口服避孕药后可恢复正常排卵，不会导致不孕不育；

2、紧急避孕药：成分为大剂量的孕激素，对机体内分泌状态的干扰相对比较明显，服用后可能会出现恶心、呕吐、乳房增大、乳房触痛、乏力、食欲亢进、痤疮等症状表现；如果短期内多次服用紧急避孕药，可能会导致阴道出血或月经量减少等症状，严重时有可能会导致不孕不育。

16岁发生性行为相对较早，此时如果口服紧急避孕药，可能会对身体产生一定损伤。虽不一定会导致不孕不育，但并不建议用这种避孕方式，仍然有一定的健康风险。可以在保证自身健康安全的前提下，可通过男性佩戴避孕套等方式进行避孕。