浙江大学医学院附属儿童医院普外科创建于60年代初期，目前为国内规模最大的小儿普通外科诊疗专科之一，是浙江省最大的小儿外科专科培训基地。普外科分滨江院区和湖滨院区两个院区，拥有主任医师5名，副主任医师4名，主治医师8名，博士4名，硕士15名。其中有3人在中华医学会小儿外科分会学组委员中任职。科室拥有专业的护理团队，其中包括主管护师9名，护师19名，护士4名。设有专科病房，其中滨江院区床位45张，VIP床位2张，湖滨院区床位42张，VIP床位2张。

科室对先天性胆总管囊肿、先天性巨结肠、肛门直肠畸形、门脉高压、腹部外伤、小儿急腹症、腹部肿物、消化道出血、体表肿物、腹股沟斜疝等疾病有较高的诊疗水平，其中，对于小儿门静脉高压分流手术包括REX手术，Warren手术，脾肾分流术积累了丰富的经验。腹腔镜胆总管囊肿根治术是小儿腹腔镜手术中最高难度之一的手术，目前已经完成腹腔镜胆总管囊肿根治手术超500例，成为国内完成该手术的最大中心之一。此外，腹腔镜先天性巨结肠根治术，腹腔镜巨脾切除术和腹腔镜脾部分切除术，DSA引导下脾动脉栓塞腹腔镜下巨脾切除“杂交”手术等高难度4级手术也是中心的特色，中心同时开展小儿普外的其他各种腔镜微创手术，包括腹腔镜阑尾切除术，腹腔镜腹股沟斜疝手术，腹腔镜Meckel’s憩室切除术,腹腔镜肠重复畸形切除术等，手术方式先进、技术精湛、治疗效果优良，医疗水平达到国内先进。