在版本控制系统（例如Git）中，当多个人在同一时间对同一个文件进行修改时，就会发生冲突。为了解决这些冲突，Git提供了合并（merge）和重置（rebase）等工具。

“要整合的更改”指的是在合并或重置过程中，Git自动检测到的另一方做出的修改。当Git检测到冲突时，它会提示用户解决冲突并提交更改。如果用户没有手动解决冲突，Git就会使用“要整合的更改”来尝试自动合并更改。

底层原理是，在Git内部，每个修改都有一个唯一的哈希值。当多个人对同一个文件进行修改时，Git会将这些修改分别存储在不同的分支上，并尝试将它们合并成一个分支。如果Git检测到冲突，它会尝试自动合并文件，使用“要整合的更改”来解决冲突。

然而，自动合并并不总是完美的。有些修改可能会被忽略或错误地合并，从而导致程序出现问题。因此，在处理冲突时，建议仔细检查每个修改并手动解决冲突，而不是完全依赖自动合并。