耳朵里面一阵一阵的疼，主要原因如下：

1、神经痛：要先判断病程的时间长短，如果疼痛不是很剧烈，并且能够耐受，一般有可能是一种神经痛，比如耳大神经痛或者耳后神经痛，可以先观察，在3-5天可以逐渐缓解和自愈。但如果疼痛明显，可以适当使用止痛药，比如布洛芬或者神经止痛药卡马西平；

2、中耳炎：如果有中耳炎，比如因为感冒以后导致的耳朵痛，则要小心有急性中耳炎。急性中耳炎一般如果疼痛不严重，并且观察1-2天逐渐缓解，问题并不大，说明和病毒感染有关系。但是如果耳痛持续超过48小时，仍然持续加重，并且伴有一定程度听力下降，这个情况要小心由细菌感染导致的急性中耳炎，必要时使用抗生素进行治疗，比如阿莫西林克拉维酸钾，一般治疗7-10天，就可以得到比较好的缓解；

3、咽鼓管功能紊乱：咽鼓管是连接鼻咽部和中耳腔的管道。如果其异常开放或者功能紊乱的时候，有可能在打嗝或者吞咽的时候，耳朵会有一些疼痛不舒服的症状。但一般疼痛不会很严重，可以观察，一般可以自愈。