宋晨

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宋晨

2024-07-12 08:55| 来源: 网络整理| 查看: 265

 

研究员、长聘副教授、博士生导师

电话:010-62759559邮箱:c.song_at_pku.edu.cn实验室主页: https://cqb.pku.edu.cn/songgroup/ 

担任职务:

北京大学定量生物学中心研究员

北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员

研究方向:

理论与计算生物物理、计算生物学

研究兴趣:

宋晨研究组运用多尺度计算模拟和深度学习的方法,研究离子通道和抗菌肽等膜蛋白的微观功能机理,旨在深入理解跨膜信号传导和物质转运过程,以及膜蛋白与细胞膜的相互作用等;同时,探索相关膜蛋白的改造设计,以及靶向膜体系的药物分子的设计与优化等。

教育经历:

2007年毕业于山东大学物理学院,获凝聚态物理博士学位

2002年毕业于山东大学物理学院,获物理学学士学位

工作经历:

2023年8月至今,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,长聘副教授

2016年4月-2023年7月,北京大学前沿交叉学科研究院,研究员,预聘助理教授

2013-2015,英国牛津大学,牛顿国际学者,玛丽居里学者

2010-2012,德国马克斯·普朗克研究所(生物物理化学所),洪堡博士后,马克斯·普朗克博士后

2007-2009,澳大利亚西澳大学,博士后

代表性文章:

1. Kang, K.†; Wang, L.†; Song, C.* ProtRAP: Predicting Lipid Accessibility Together with Solvent Accessibility of Proteins in One Run. J. Chem. Inf. Model. 2023, 63, 1058-1065.

2. Wang, L.; Zhang, J.; Wang, D.; Song, C.* Membrane Contact Probability: An Essential and Predictive Character for the Structural and Functional Studies of Membrane Proteins. PLoS Comput. Biol. 2022, 18, e1009972.

3. Wang, Y.†; Guo, Y.†; Li, G.; Liu, C.; Wang, L.; Zhang, A.; Yan, Z.*; Song, C.* The Push-to-Open Mechanism of the Tethered Mechanosensitive Ion Channel NompC. eLife 2021, 10, e58388.

4. Zhang, A.; Yu, H.; Liu, C.; Song, C.* The Ca2+ Permeation Mechanism of the Ryanodine Receptor Revealed by a Multi-Site Ion Model. Nat. Commun. 2020, 11, 922.

5. Zhang, M.; Wang, D.; Kang, Y.; Wu, J.-X.; Yao, F.; Pan, C.; Yan, Z.*; Song, C.*; Chen, L.* Structure of the Mechanosensitive OSCA Channels. Nat. Struct. Mol. Biol. 2018, 25, 850–858.

6. Köpfer, D. A.†; Song, C.†*; Gruene, T.; Sheldrick, G. M.; Zachariae, U.*; de Groot, B. L.* Ion Permeation in K+ Channels Occurs by Direct Coulomb Knock-On. Science 2014, 346, 352–355.



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