第十二章 蛋白质的生物合成

1．密码子（codon）：存在于信使RNA 中的三个相邻的核苷酸顺序，是蛋白质合成中某一特定氨基酸的密码单位。密码子确定哪一种氨基酸叁入蛋白质多肽链的特定位置上；共有64 个密码子,其中61 个是氨基酸的密码，3 个是作为终止密码子。

2．同义密码子（synonym codon）：为同一种氨基酸编码的几个密码子之一，例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码。

3．反密码子（anticodon）：在转移RNA 反密码子环中的三个核苷酸的序列，在蛋白质合成中通过互补的碱基配对，这部分结合到信使RNA 的特殊密码上。

4．变偶假说（Wobble hypothesis）：克里克为解释tRNA 分子如何去识别不止一个密码子而提出的一种假说。据此假说，反密码子的前两个碱基（3ˊ端）按照碱基配对的一般规律与密码子的前两个（5ˊ端）碱基配对，然而tRNA 反密码子中的第三个碱基，在与密码子上3ˊ端的碱基形成氢键时，则可有某种程度的变动，使其有可能与几种不同的碱基配对。

5．移码突变（frame-shift mutation）：一种突变，其结果为导致核酸的核苷酸顺序之间的正常关系发生改变。移码突变是由删去或插入一个核苷酸的点突变构成的，在这种情况下，突变点以前的密码子并不改变，并将决定正确的氨基酸顺序；但突变点以后的所有密码子都将改变。且将决定错误的氨基酸顺序。

6．氨基酸同功受体（isoacceptor）：每一个氨基酸可以有多过一个tRNA 作为运载工具，这些tRNA 称为该氨基酸同功受体。

7．反义RNA（antisense RNA）：具有互补序列的RNA。反义RNA 可以通过互补序列与特定的mRNA 相结合，结合位置包括mRNA 结合核糖体的序列（SD 序列）和起始密码子AUG，从而抑制mRNA 的翻译。又称干扰mRNA 的互补RNA。

8． 信号肽（signal peptide）: 信号肽假说认为，编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N 末端带有疏水氨基酸残基的信号肽，它被内质网膜上的受体识别并与之相结合。信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔，随即被位于腔表面的信号肽酶水解，由于它的引导，新生的多肽就能够通过内质网膜进入腔内，最终被分泌到胞外。翻译结束后，核糖体亚基解聚、孔道消失，内质网膜又恢复原先的脂双层结构。

9. 简并密码（degenerate codon）：或称同义密码子（synonym codon），为同一种氨基酸编码几个密码子之一，例如密码子UUU 和UUC 二者都为苯丙氨酸编码。

10.核糖体（ribosome）: 核糖体是很多亚细胞核蛋白颗粒中的一个，由大约等量的RNA和蛋白质所组成，是细胞内蛋白质合成的场所。每个核糖核蛋白体在外形上近似圆形，直径约为20nm。由两个不相同的亚基组成，这两个亚基通过镁离子和其它非共价键地结合在一起。已证实有四类核糖核蛋白体（细菌、植物、动物和线粒体）它们以其单体的、亚单位的和核糖核蛋白体RNA 的沉降系数相区别。细菌核蛋白体含有约50 个不同的蛋白质分子和3 个不同的RNA 分子。小的亚单位含有约20个蛋白质分子和1 个RNA分子。大的亚单位含有约30 个蛋白质分子和2 个RNA 分子。核蛋白体有两个结合转移RNA 的部位（部位和部位），并且也能附上信使RNA，简写为Rb。

11．多核糖体（polysome）:在信使核糖核酸链上附着两个或更多的核糖体。

12．氨酰基部位（aminoacyl site）：在蛋白质合成过程中进入的氨酰-tRNA结合在核蛋白体上的部位。

13．肽酰基部位（peptidy site）：指在蛋白质合成过程中，当下一个氨酰基转移RNA接到核糖核蛋白体的氨基部位时，肽酰tRNA所在核蛋白体上的结合点。

14．肽基转移酶（peptidyl transferase）：蛋白质合成中的一种酶。它能催化正在增长的多肽链与下一个氨基酸之间形成肽键。在细菌中此酶是50S 核糖核蛋白体亚单位中的蛋白质之一。

15．氨酰-tRNA 合成酶（amino acy-tRNA synthetase）：催化氨基酸激活的偶联反应的酶，先是一种氨基酸连接到AMP 生成一种氨酰腺苷酸，然后连接到转移RNA 分子生成氨酰-tRNA 分子。

16．蛋白质折叠（protein folding）：蛋白质的三维构象，称为蛋白质的折叠。是由蛋白质多肽链的氨基酸顺序所决定的。不同的蛋白质有不同的氨基酸顺序，也就各自按照一定的方式折叠而成该蛋白质独有的天然构象。这个蛋白质折叠是在自然条件下自发进行的，在生物体内条件下，它是在热力学上最稳定的形式。多肽链在核糖体上一面延长，一面自发地折叠成其本身独有的构象。当肽链终止延长并从核糖体上脱落时，它也就折叠成天然的三维结构。

17．核蛋白体循环（polyribosome）：是指已活化的氨基酸由tRNA转运到核蛋白体合成多肽链的过程。

18．锌指（zine finger）：是调控转录的蛋白质因子中与DNA 结合的一种基元，它由大约30 个氨基酸残基的肽段与锌螯合形成的指形结构，锌以4 个配位键与肽链的Cys或His 残基结合，指形突起的肽段含12-13 个氨基酸残基，指形突起嵌入DNA 的大沟中，由指形突起或其附近的某些氨基酸侧链与DNA 的碱基结合而实现蛋白质与DNA 的结合。

19．亮氨酸拉链（leucine zipper）：这是真核生物转录调控蛋白与蛋白质及与DNA 结合的基元之一。两个蛋白质分子近处C 端肽段各自形成两性α-螺旋，α-螺旋的肽段每隔7 个氨基酸残基出现一个亮氨酸残基，两个α-螺旋的疏水面互相靠拢，两排亮氨酸残基疏水侧链排列成拉链状形成疏水键使蛋白质结合成二聚体，α-螺旋的上游富含碱性氨基酸（Arg 、Lys）肽段借Arg 、Lys 侧链基团与DNA 的碱基互相结合而实现蛋白质与DNA 的特异结合。

20．顺式作用元件（cis-acting element）：真核生物DNA 的转录启动子和增强子等序列，合称顺式作用元件。

21．反式作用因子（trans-acting factor）：调控转录的各种蛋白质因子总称反式作用因子。

22．螺旋环螺旋（helix-loop-helix）：这种蛋白质基元由两个两性α螺旋通过一个肽段连结形成螺旋环螺旋结构，两个蛋白质通过两性螺旋的疏水面互相结合，与DNA 的结合则依靠此基元附近的碱性氨基酸侧链基团与DNA 的碱基结合而实现。