R语言与临床模型预测 |
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1.下载数据 2. 匹配基因 3. 基因去重复 4.匹配临床数据 5.批量cox回归分析 6.差异表达基因筛选 7.取交集,选出预后相关的差异表达基因 8.森林图绘制 9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因 10.验证集验证,数据合并验证 11.多因素cox回归建模 12.列线图 13.矫正曲线 14.ROC曲线分析 上次筛选了预后相关差异基因,下面我们开始对这些基因进行lasso-cox回归: 下面数据准备: 这是之前做批量cox回归分析时生成的文件,内容如下: 这里的基因是所有的自噬相关基因。 下面我们还需要另一个文件: 这是Venn图取交集后得到的基因。 |
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