诊断试验的meta分析

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诊断试验的meta分析

2024-07-16 13:42| 来源: 网络整理| 查看: 265

诊断试验的meta分析

  在诊断试验中,通过金标准诊断为患者和非患者,采用某种试验方法诊断为阳性或阴性,列成四格表的形式,计算相关指标评价该试验方法的价值。单个诊断试验中,常用灵敏度、特异度、似然比、预测值等评价诊断试验的价值。

  除上述我们熟悉的指标外,我们需要了解下列指标:

  诊断优势比(DOR)=真阳性*真阴性/(假阳性*假阴性),主要用于诊断试验meta分析中,作为meta分析合并时每个诊断试验权重的依据。

  SROC曲线是根据单个诊断试验中的诊断优势比的权重,绘制的集成ROC曲线。从SROC曲线上可以得到每一个研究的灵敏度和特异度,在存在阈值效应时,该方法最适合。在绘制SROC曲线的基础上,可计算SROC曲线下面积以及Q指数。Q指数为在SROC曲线上,灵敏度=特异度,且最靠近左上角的坐标。

  接下来,我们看看诊断试验meta分析的步骤。

  与其他类型的meta分析不同的是,诊断试验meta分析中,阈值效应是异质性的重要来源。阈值效应是因为单个诊断试验中采用不同的诊断界值引起的。当存在阈值效应时,随着灵敏度的增加,特异度逐渐减小,反之亦然。

  我们常通过计算灵敏度与特异度的Spearman相关系数探讨阈值效应,二者之间若存在强负相关则提示存在阈值效应。但需要注意的是,灵敏度与特异度的相关并不一定都是由阈值效应引起。

  当不存在阈值效应时,可以直接合并灵敏度、特异度等单一评价指标;当存在阈值效应时,应采用SROC曲线法,计算SROC曲线下面积和Q指数。

  目前,可用来进行诊断试验meta分析的软件有RevMan、meta-DiSc、Stata、R软件等。今天,我们以R软件的meta4diag程序包为例,演示下如何做诊断试验的meta分析。

  meta4diag程序包的功能是基于INLA实现的, 因此在使用时还需同时安装相关程序包,即INLA 程序包和sp程序包,程序如下:

  (1)下载程序包,若运行出错,可通过R/RStudio的工具栏,手动安装。

  install.packages("meta4diag")

  install.packages("INLA", repos="http://www.math.ntnu.no/inla/R/testing")

  (2)加载程序包。library(meta4diag);library(INLA)。

  (3)读取数据。mydata



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