1、加班清零不一定是违法的。相关法律制度并没有规定加班时间不得清零，记录加班时间的目的主要是为了使职员可以获得自己本应该能够获得单位支付的加班费，故此若是单位在在将职员的加班时间清零之前，已经遵守规定向支付支付了加班费，那么单位将加班费清零的行为就并不违法。2、法律依据：《劳动法》第四十四条 有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：(1)安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬;(2)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬;(3)法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。