干货│免疫共沉淀(CoIP)原理概述及操作流程

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干货│免疫共沉淀(CoIP)原理概述及操作流程

2023-07-16 17:07| 来源: 网络整理| 查看: 265

胃蛋白酶抑制剂(Pepstatin)(用甲醇配制成1 mg/ml 的储存液,分装,-20℃保存)

RIPA磷酸(酯)酶抑制剂

激活的Na3VO4(用H2O配制成200 mM 的储存液,见Sodium Orthovanadate Activation Protocol)

NaF(200 mM 的储存液,室温保存)

注意:在准备做磷酸(酯)酶实验的时候,不加磷酸酯酶抑制剂

工作液配制:

配制100 ml 的modified RIPA buffe:

1. 称取790 mg 的Tris-Base,加到75ml 去离子水中,加入900 mg 的NaCl,搅拌,直到全部溶解,用HCl调节PH值到7.4。

2. 加10 ml 10%的NP-40 。

3. 加2.5 ml 10%的去氧胆酸钠,搅拌,直到溶液澄清 。

4. 加1 ml 100mM的EDTA,用量筒定容到100ml,2-8℃保存 。

5. 理论上,蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂应该在使用当天同时加入(抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂各100 μl; PMSF, Na3VO4, NaF各500 μl),但是PMSF在水溶液中很不稳定,30分钟就会降解一半,所以PMSF应该在使用前现加,其他抑制剂成分可以在水溶液中稳定5天。

各种成分在工作液中的终浓度:

Tris-HCl: 50 mM, pH 7.4

NP-40: 1%

去氧胆酸钠:0.25%

NaCl: 150 mM

EDTA: 1 mM

PMSF: 1 mM

抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂: 各1 μg/ml

Na3VO4: 1 mM

NaF: 1 mM

免疫共沉淀技术路线

1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次,最后一次吸干PBS。

2. 加入预冷的RIPA Buffer(1 ml/107个细胞、10 cm 培养皿或150 cm2 培养瓶,0.5 ml/5×106个细胞、6 cm 培养皿、75 cm2 培养瓶)。

3. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下,把悬液转到1.5 ml EP管中,4℃,缓慢晃动15 min(EP管插冰上,置水平摇床上)。

4. 4℃,14000 g 离心15 min,立即将上清转移到一个新的离心管中。

5. 准备Protein A agarose,用PBS 洗两遍珠子,然后用PBS配制成50%浓度,建议减掉枪尖部分,避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠。

6. 每1 ml 总蛋白中加入100 μl Protein A琼脂糖珠(50%),4℃摇晃10 min(EP管插冰上,置水平摇床上),以去除非特异性杂蛋白,降低背景。

7. 4℃,14000g离心15min,将上清转移到一个新的离心管中,去除Protein A珠子。

8. (Bradford 法)做蛋白标准曲线,测定蛋白浓度,测前将总蛋白至少稀释1:10倍以上,以减少细胞裂解液中去垢剂的影响(定量,分装后,可以在-20℃保存一个月)。

9. 用PBS将总蛋白稀释到约1 μg/μl,以降低裂解液中去垢剂的浓度,如果兴趣蛋白在细胞中含量较低,则总蛋白浓度应该稍高(如10 μg/μl)。

10. 加入一定体积的兔抗到500 μl 总蛋白中,抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异。

11. 4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2 h,激酶或磷酸酯酶活性分析建议用2 h室温孵育。

12. 加入100 μl Protein A琼脂糖珠来捕捉抗原抗体复合物,4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1 h,如果所用抗体为鼠抗或鸡抗,建议加2 μl“过渡抗体”(兔抗鼠IgG,兔抗鸡IgG)。

13. 14000 rpm 瞬时离心5 s,收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物,去上清,用预冷的RIPA buffer洗3遍,800 μl/遍,RIPA buffer有时候会破坏琼脂糖珠-抗原抗体复合物内部的结合,可以使用PBS。

14. 用60 μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起,轻轻混匀,缓冲液的量依据上样多少的需要而定(60 μl 足够上三道)。

15. 将上样样品煮5 min,以游离抗原,抗体,珠子,离心,将上清电泳,收集剩余琼脂糖珠,上清也可以暂时冻-20℃,留待以后电泳,电泳前应再次煮5 min 变性。

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