NCS质感图表:Seurat单细胞DotPlot函数基因表达气泡图修饰

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NCS质感图表:Seurat单细胞DotPlot函数基因表达气泡图修饰

2024-07-07 06:26| 来源: 网络整理| 查看: 265

关于单细胞气泡图的做法,我们写过很多很多,但是这些图基本上都是利用Seurat提取了数据,然后在ggplot2中完成的。因为Seurat包中的DotPlot函数的底层就是ggplot2,所以这里我们决定就是用Dotplot函数,然后进行修饰,得到具有NCS质感的图片。

当然了,这篇内容对于高手来说没什么,但是对于一般学习者而言,我们解决的问题有:1、基本函数的使用技巧。2、气泡图注释拼图。首先我们读入数据做一个气泡图。横坐标当然是基因了,纵坐标我们不希望是celltype,而是既包含celltype,还包含分组信息的,于是我们这样作图:

library(Seurat) library(ggplot2) library(cowplot) markers


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