做生信中，最常做的一个工作就是富集分析，例如GO/Pathway富集分析等，而GO/Pathway分析富集的结果目前来说常用气泡图来展示，当然也有人用bar图等，但是相对来说个人还是觉得气泡图好看点。今天包括后面几个帖子我们就学习气泡图的画法。

GO/Pathway富集分析我就不多讲了，有很多现场的工具，如果不是模式生物在，自己计算个超几何分布也能方便的算出富集的结果。一般富集完，我们会得到富集的GO/Pathway，以及相应的pvalue，GO/Pathway上的基因数目以及和自己输入基因overlap的基因数目（这个一般就是常见的Richfactor计算方式）。下面是我们这个part用到的测试数据，其实也是我真实数据的一部分。包括的内容比较多有多个时间点的GO富集结果，只不过我放在一个文件中了。

今天我们先测试一个时间点，也就是一个富集结果的画法。一般一个样品的富集结果的话，x轴是RichFactor，Y轴是GO或者pathway，颜色代表pvalue，大小用proteinNumber来展示。

library(ggplot2)

library(ggthemes)

data