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ImageJ分析细胞划痕面积 那么如何在ImageJ中实现上图划痕面积和伤口愈合百分比的分析呢?这时候ImageJ就可以派上大用场,ImageJ这个图像分析大杀器,让实验结果所暗藏的规律清晰明了地呈现你的面前。 我们只需统计划痕面积(Scratch Area)随着时间的变化率以及伤口愈合百分比(Wound healing percentage),即可对细胞的侵袭性了如指掌。下面看详细步骤: 步骤一 打开ImageJ软件,其界面:File,Open,选择待分析图片(图一),界面如下: 步骤二 增强对比:Process,Enhance Contrast,出现如界面: 勾上Normalize,Saturated pixels:0.3%,点击OK,效果如下: Process,Smooth(平滑),效果如下: Process,Find Edges(寻找边缘),效果如下: 步骤三 Image,Adjust,Threshold,阈值选定,选中为红色,调节阈值为0—20。点击Apply。 效果如下: 步骤四 选择魔棒工具,魔棒工具位于下图右下角: 点击黑色的划痕部分,效果如下: 点击Analyze,Measure,结果如下,划痕面积Area为43328平方像素。根据最开始的划痕面积,跟某一时间愈合的那一部分面积(最开始面积-某时间点的面积)与最初面积的比值即可得到伤口愈合的百分比。 由此我们得到了划痕面积(Scratch Area)随着时间的变化、伤口愈合百分比(Wound healing percentage),进行后续统计分析即可。 ImageJ用来细胞共定位也非常的强大方便,下期我们讲解,共同期待! 文章来源:每日生物评论,欢迎关注微信公众号:每日生物评论,留言给我们一起探讨并学习!返回搜狐,查看更多 |
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