差异分析是一种统计方法，用于比较两个或多个组之间的差异，以确定它们在某些方面上是否存在显著的差异。这种方法通常用于研究不同处理或条件下的平均值之间的差异，例如在生物学、社会科学和工程领域等。

在统计学中，差异分析通常包括方差分析（ANOVA）和t检验等方法。方差分析适用于比较三个或三个以上组的平均值，而t检验用于比较两组之间的平均值差异。

差异分析的目的是确定不同组之间的差异是否由随机因素引起还是真实存在的。通过差异分析，研究人员可以确定实验结果的可靠性，并得出该差异是否具有统计学上的显著性结论。

简单来说，差异分析就是分析两组数据是否有差异。比如，北方人的身高是否显著高于南方人的身高？在这其中涉及到“显著”的定义。对于显著，可以理解为判定条件。要用统计学来说话，通常是对两组数据的差异倍数进行统计学检验，得到Pvalue值，当Pvalue值达到某一阈值时，则显著差异。

在转录组的基因差异表达分析中，一般的筛选标准是基因表达差异倍数大于2、并且FDR