卵圆窝是胎儿时期卵圆孔闭合后的遗迹，在右心房的后内侧壁或房间隔下部卵圆形的浅凹。

房间隔缺损常发生在该处，也是从右心房进入左心房心导管穿刺的理想部位。

颅底蝶鞍的两侧，各有一个卵圆孔的结构。其内走行的是三叉神经的下颌支，鼻咽癌容易侵犯这个部位。另一个解剖上的卵圆孔，位于胚胎时期左右心房的隔膜处，是一个开放的孔道。血流从右向左流动。出生后，卵圆孔就闭合了，有小部分人群没有闭合，称之为卵圆孔未闭，属于先天性心脏疾病。

房间隔上的卵圆窝不闭合会影响心肺功能，继而影响生长发育。如果学龄前仍未闭合，可以考虑通过介入治疗对卵圆窝处进行封堵。