机管局努力推进三跑道系统项目的同时，亦致力确保发展与环境保育的平衡。

机管局就三跑道系统进行全面的环境影响评估。环评涵盖超过250项缓解措施，包括免挖式填海方法、于工程展开前及进行期间推行环境监察及审核计划、在北大屿山水域划定面积约2 400公顷的海岸公园等，以应对及缓解在12个主要环境范畴可能造成的影响。

机管局致力履行在《环评报告》作出的所有承诺，并遵守其后在三跑道系统项目环境许可证列出的条件及规定。机管局亦已设立专题网站 http://env.threerunwaysystem.com，汇报环境监察及审核数据，以及其他三跑道系统项目相关资料。