3月11日，Nature Biotechnology杂志在线发表了中科院北京生命科学研究院赵方庆教授的最新文章，报道通过优化纳米孔三代测序体系，实现circRNA全长序列的分析（[1]）。

基于纳米孔测序和CIRI-long的circRNA全长分析技术流程

总RNA去除rRNA后通过末端加PolyA处理，以增加RNase R处理的效率。产物通过随机引物和SMARTer反转录，获得携带多个全长拷贝的反转录产物，这期间添加SMATer接头。最后的产物经过磁珠富集长片段，通过MinION platform纳米孔测序。测序数据经过过滤和接头序列处理后，利用作者开发的CIRI-long分析流程进行circRNA分析。CIRI-long算法的分析流程是首先从测序Reads中基于k-mer的方法，识别出扩增测序Reads中包含的circRNA全长序列的多重拷贝重复片段，生成高准确性的circRNA全长一致性序列（CCS）。得到CCS序列后再通过参考基因组比对，对其中的反向剪切位点及内部可能存在的可变剪切进行匹配识别，最终实现单一样本内或多样本间circRNA全长的准确识别和全长重构。

利用该技术体系，作者测试后发现可以比传统的测序分析方案检测灵敏度提高了20倍，可实现