做过10xGenomics单细胞转录组的人都知道cellranger的标准输出是三个文件（barcodes.tsv genes.tsv matrix.mtx），由这三个文件组成表达矩阵，其实这么做的原因就是为了节省空间以及加快导入速度，matrix是一种十分有效的数据存储方式，一般可以通过Matrix::readMM读取matrix矩阵，一直以来，我以为cellranger输出的matrix.mtx矩阵与其他的矩阵没有区别的，但是最近在做另外的一个软件kallistobustools比对的时候发现有点不对劲，由于其输出结果也是三个矩阵，但是有个前缀，我想着对Seurat的Read10X的函数进行改写一下，增加前缀、后缀的参数就可以了，结果改完了以后，始终报如下的错误：

  开始以为是我的输入文件的问题，我检查了genes.tsv文件，发现kallistobustools只有一列，因此我有添加了一列，结果还发现报错，然后想看看matrix.mtx文件，发现其行数和列数也能对上，怎么就不对呢？这个问题弄了很久，后面实在没法了，就一行一行的运行，后面发现在给矩阵列名的时候有问题。

  既然这里报错了，那就看看这两个文件的区别，后我通过dim(data)，发现行列数目对不上，我这才去认真的检测两个matrix.mtx的区别。