SnapGene功能介绍

      1、成对对齐

      可以通过局部，全局或半全局比对来分析成对的DNA或蛋白质序列。

      2、从Ensembl导入

      现在可以将来自Ensembl基因组浏览器的基因或转录数据直接导入SnapGene。

      3、定向TOPO ®克隆

      一个新的界面会模拟定向TOPO ®克隆到拓扑异构酶活化载体。

      4、灵活地对准参考

      与参考DNA序列比对的界面已得到增强。各种显示选项的控件更加直观，并且可以将比对限制在参考序列的指定链或区域内。

      5、可拖动的不对齐端

      对于已与参考DNA序列部分比对的序列，现在可以将未比对的末端部分拖出并可视化。

      6、Anza™酶

      Thermo Fisher(Invitrogen)的Anza™酶系统已合并到SnapGene的酶数据库中。

      7、可自定义的背景色

      可以更改SnapGene接口的背景颜色。

      8、要素类型的可见性控件

      可以根据要素类型显示或隐藏要素。

      9、氨基酸的新选择

      可以将翻译特征中的氨基酸设置为小写，并且可以以3个字母的格式复制一段氨基酸。

      10、密码子频率计算器

      可以为一个或多个翻译特征生成密码子频率表。

      11、DNA到蛋白质的比对转换

      可以翻译DNA比对的选定区域以产生相应的蛋白质比对。

      12、比对cDNA的内含子注释

      当cDNA与参考基因组DNA序列比对时，该cDNA可用于创建一个特征，其中的缺口被注释为内含子。

      13、地图中的扩展选择端点

      现在，选择项用加长线标记，这可以阐明选择端点，还可以增强小选择项的可见性。

      14、DNASIS文件导入器

      SnapGene现在可以识别传统DNASIS程序中的文件。

SnapGene软件特色

      1、看看你在想什么

      确切地查看正在做什么，从而简化克隆。

      2、看看你在想什么

      确切地查看正在做什么，从而简化克隆。

      3、瞬间模拟

      轻松计划克隆，并以您认为的最快速度进行仿真。

      4、准确克隆

      通过在计划错误发生之前及时发现它们，防止浪费和沮丧。

      5、保留完整记录

      自动生成每个序列编辑和克隆过程的丰富图形历史记录。

      6、拥有您的数据

      完全控制序列的存储位置。

      7、转换和共享数据

      从常见文件格式导入序列和注释。

SnapGene软件优势

      一、想象

      1、DNA可视化

      查看DNA序列的多个视图。

      地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史

      自定义酶位点，特征，引物，ORF，DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。

      使用双链模式查看酶位点，具有翻译，引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。

      从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行，按名称或频率排序。

      按名称，位置，大小，颜色，方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

      按名称，长度，颜色，结合位点，方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

      查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复

      2、大序列支持

      浏览染色体大小序列。

      查看 · 搜索 · 缩放

      利用SnapGene的高效数据处理功能，扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。

      使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。

      使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。

      3、蛋白质可视化

      查看蛋白质序列的多个视图。

      地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史

      自定义区域，站点，键和序列颜色的显示。

      使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。

      查看蛋白质的分子量，消光系数，等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。

      按名称，位置，大小，颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。

      查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。

      4、直观的序列编辑

      轻松编辑DNA和蛋白质序列。

      标准编辑 · DNA结束

      进行插入，删除，替换和大小写更改。复制并粘贴序列时，会自动传输功能。

      编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

      5、序列颜色编码

      将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。

      给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。

      6、特征注释

      自动注释常用功能，或手动注释新功能。

      自动特征检测 · 手动特征注释

      使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。

      选择DNA或蛋白质序列的一部分，并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。

      二、模拟

      1、限制性站点指标

      确认限制性网站适合克隆。

      独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质

      以粗体显示独特的限制性位点，或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。

      不要被愚弄，因为限制性位点被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点。

      利用工具提示来避免有问题的限制网站。

      2、限制性克隆

      可视化克隆过程的所有方面。

      如果您已经考虑过程，则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷，则可以捕获并纠正错误。

      3、PCR

      模拟标准PCR。

      使用您自己的引物，或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。

      4、重叠延伸PCR

      通过重叠延伸PCR融合片段

      最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向，SnapGene将设计引物。

      5、引物定向诱变

      使用诱变引物进行定点诱变。

      选择诱变引物，按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。

      6、网关®克隆

      模拟网关® BP克隆或LR克隆，或两者在同一时间。

      为方便起见，提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段，SnapGene将设计引物。

      7、吉布森大会®

      通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。

      选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

      8、IN-FUSION ®克隆

      通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法，可用于创建无缝基因融合。

      选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

      9、TA和GC克隆

      通过TA或GC克隆捕获PCR产物。

      选择传统的TA克隆或高效GC克隆。

      为方便起见，提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。

      10、退火Oligos

      退火两个寡核苷酸形成双链产物。

      使用简单的控件添加突出限制克隆。

      三、避免错误

      使用SnapGene，确保构造符合您的要求，并确认您获得了所需的序列。

      1、阅读基因融合的框架

      确保构造中的已转换要素符合框架。

      链接翻译 · 警告信息

      使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样，翻译链接在同一行。如果不是，则翻译在单独的行上。

      2、与参考序列对齐

      使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。

      地图概述 · 序列详细信息

      请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述，以及存在差异的位置。

      四、自动录制

      SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录，并将祖先结构存储在最终文件中。

      1、全面的“撤销”能力

      几乎撤消任何操作。

      不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。

      2、历史和嵌入式祖先

      查看构造的图形历史记录。

      单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分，或单击PCR引物名称以查看引物序列。

      单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件，包括其注释和克隆历史记录。

      3、历史色彩

      使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。

      详细了解构建体的组装方式，包括结扎的粘性末端。

      五、拥有你的数据

      SnapGene允许您根据需要阅读和共享文件，同时保持对数据的完全控制。

      1、安全文件管理

      将SnapGene文件保存在所需的位置。

      使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。

      2、从其他格式导入

      阅读许多常见的文件格式。

      不仅可以导入DNA序列，还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商，以确保您不会被锁定为专有文件格式。

      3、导出为标准格式

      将序列，地图或凝胶图像转换为标准格式，以便与其他软件一起使用。

      将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。

      4、使用SnapGene Viewer共享数据

      将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。

      只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图，序列和注释，就像在完整的SnapGene界面中一样。

      5、对于开发人员

      要将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中，请联系我们以获取有关如何读取和写入SnapGene文件的信息。

      六、转换文件格式

      开放式信息交换至关重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。

      从其他格式导入时，目标不仅是捕获DNA序列，还捕获注释和注释

SnapGene安装步骤

      1.在华军软件园下载SnapGene最新版安装包，解压后，双击“exe”文件

      2.进行安装向导，点击“Browse”选择安装位置，一般默认在C盘，推荐安装在D盘，单击Next

      3.阅读许可协议，单击I Agree

      4.选择想要安装的组件，单击Next

      5.软件信息已准备就绪，单击Install安装

      6.软件正在安装，请耐心等待

      7.SnapGene安装完成，单击Finish，退出安装向导

SnapGene更新日志

      1.细节更出众!

      2.BUG去无踪

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