聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？ |
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聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？
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生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。 聚类热图的层级关系是固定的，但分支的左右镜像是可变的。如何让聚类结果更好的呈现我们想要的顺序呢？看下面的操作。 数据示例 exprTable % as.hclust pheatmap(exprTable, cluster_cols = col_cluster)样本量多时的自动较忧排序 sv = svd(exprTable)$v[,1] dend = reorder(as.dendrogram(hclust_1), wts=sv) col_cluster |
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