R包安利 ① easyPubMed

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R包安利 ① easyPubMed

2024-07-04 05:24| 来源: 网络整理| 查看: 265

想让这张图当封面

1.1 关于 easyPubMed

作者是 Damiano Fantini ,2019-03-29 发表,甩链接。

看它的 Title: 搜索和读取 PubMed 上的文章发表信息。 看它的自我介绍: easyPubMed 可以查询 NCBI Entrez,以 XML 或 文本 格式获得 PubMed 信息,可以提取、整合数据,可以 轻 而 易 举 地下载一大堆记录信息,比如单独得到 作者、单位、题目、关键词、摘要、发表时间……

2.1 包里的函数

一共12个:

articles_to_list , article_to_df , batch_pubmed_download , custom_grep , EPMsamples, fetch_all_pubmed_ids , fetch_pubmed_data . get_pubmed_ids ,get_pubmed_ids_by_fulltitle , PubMed_stopwords , table_articles_byAuth ,trim_address

3.1 小白使用教程

第一步当然是:

library(easyPubMed)

再加载一些要用到的包:

library(XML) library(dplyr) library(kableExtra) library(parallel) library(foreach) library(doParallel) 3.1.1 简单的数据获取

以这个包的作者为例,获取TA的所有文章,[AU]-author.

query


【本文地址】


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