R包安利 ① easyPubMed |
您所在的位置:网站首页 › pubmed发表时间 › R包安利 ① easyPubMed |
想让这张图当封面 1.1 关于 easyPubMed作者是 Damiano Fantini ,2019-03-29 发表,甩链接。 看它的 Title: 搜索和读取 PubMed 上的文章发表信息。 看它的自我介绍: easyPubMed 可以查询 NCBI Entrez,以 XML 或 文本 格式获得 PubMed 信息,可以提取、整合数据,可以 轻 而 易 举 地下载一大堆记录信息,比如单独得到 作者、单位、题目、关键词、摘要、发表时间…… 2.1 包里的函数一共12个: articles_to_list , article_to_df , batch_pubmed_download , custom_grep , EPMsamples, fetch_all_pubmed_ids , fetch_pubmed_data . get_pubmed_ids ,get_pubmed_ids_by_fulltitle , PubMed_stopwords , table_articles_byAuth ,trim_address 3.1 小白使用教程第一步当然是: library(easyPubMed)再加载一些要用到的包: library(XML) library(dplyr) library(kableExtra) library(parallel) library(foreach) library(doParallel) 3.1.1 简单的数据获取以这个包的作者为例,获取TA的所有文章,[AU]-author. query |
今日新闻 |
推荐新闻 |
CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3 |