ImageJ是一款开源图像处理软件，最初由美国国立卫生研究院（NIH）开发，用于生物医学图像处理。现在已经成为生命科学和材料科学领域最常用的图像处理软件之一。ImageJ具有图像处理、图像分析、图像显示和图像处理插件等功能，可以处理各种类型的图像，包括2D和3D图像。它可以在Windows、MacOSX和Linux等操作系统上运行，并且可以在不同的计算机平台之间进行数据交换。ImageJ的主要特点是易于使用和灵活性。它提供了许多常用的图像处理和分析功能，例如图像增强、傅里叶变换、形态学操作、图像分割、二值化和测量等。此外，ImageJ还可以通过插件进行扩展，用户可以根据自己的需求选择不同的插件来增强其功能。ImageJ的应用范围非常广泛，包括生物医学、材料科学、地球科学、环境科学、工程学和物理学等领域。它可以用于细胞图像分析、药物筛选、组织学图像分析、纳米材料图像分析、地球物理图像处理和材料力学图像分析等。

基本简介

 ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件，它是由NationalInstitutesofHealth开发的。可运行于MicrosoftWindows，MacOS，MacOSX，Linux，和SharpZaurusPDA等多种平台。其基于java的特点，使得它编写的程序能以applet等方式分发。  ImageJ能够显示，编辑，分析，处理，保存，打印8位，16位，32位的图片，支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多种格式。ImageJ支持图像栈功能，即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像，并行处理。只要内存允许，ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作，比如缩放，旋转，扭曲，平滑处理外，ImageJ还能进行图片的区域和像素统计，间距，角度计算，能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。  ImageJ支持图像栈功能，即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像，并行处理。只要内存允许，ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作，比如缩放，旋转，扭曲，平滑处理外，ImageJ还能进行图片的区域和像素统计，间距，角度计算，能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。

 ImageJ支持用户自定义插件和宏。ImageJ自带编辑器，并且导入了java的编译器，实现了简单的IDE功能，用户可直接基于ImageJ进行图像处理。  ImageJ通过Java插件被设计为开放体系结构的，可以获取定制的分析、处理插件，这些插件都能够使用ImageJ内置的编辑器和编译器。用户自定义插件可以解决几乎所有图像处理和分析方面的问题。  ImageJ的源代码免费提供。  主面由菜单栏，工具栏和状态栏组成。  菜单栏包括：文件，编辑，图形，处理，分析，插件，窗口，帮助。  文件主要有:文件打开，关闭，保存等功能，比较特殊的一个功能是恢复功能。可以直接回到上次保存过的状态。 ImageJ是一款功能强大、易于使用且灵活的图像处理软件，可以满足不同领域的图像处理和分析需求。

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